More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1459 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1459  LicC protein  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  38.5 
 
 
227 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  38.05 
 
 
227 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  31.67 
 
 
522 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  28.96 
 
 
595 aa  98.6  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  30.32 
 
 
592 aa  96.7  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.76 
 
 
611 aa  94  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  29.52 
 
 
619 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
589 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.58 
 
 
590 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  27.6 
 
 
596 aa  81.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  27.56 
 
 
300 aa  79  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
388 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  32.77 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  33.99 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.13 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  31.91 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  30.77 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  30 
 
 
399 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.13 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  28.95 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  39.08 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  33.02 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  31.21 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.25 
 
 
357 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.64 
 
 
603 aa  58.9  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  36.19 
 
 
247 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  31.13 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  33.96 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  33.02 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  35.64 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.86 
 
 
816 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
403 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  31.13 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  27.46 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  36.67 
 
 
400 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.35 
 
 
262 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  32.26 
 
 
630 aa  55.8  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.92 
 
 
784 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.92 
 
 
784 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  34.92 
 
 
784 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.92 
 
 
784 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.92 
 
 
784 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  34.92 
 
 
784 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  34.92 
 
 
784 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.83 
 
 
545 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  34.92 
 
 
784 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  35.14 
 
 
263 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.7 
 
 
556 aa  55.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  28.29 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  34.26 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.67 
 
 
568 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  34.92 
 
 
784 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  29.23 
 
 
361 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  34.92 
 
 
784 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  35.06 
 
 
399 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
392 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  52.54 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  30.17 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  28.28 
 
 
578 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  27.34 
 
 
564 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81885  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, GEF  42.65 
 
 
726 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.541559  normal  0.64637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  47.46 
 
 
384 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.44 
 
 
400 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  49.18 
 
 
383 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  23.33 
 
 
399 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.01 
 
 
400 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  32.5 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  31.54 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  34.29 
 
 
818 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  29.23 
 
 
361 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31 
 
 
357 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.91 
 
 
376 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  30.19 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.13 
 
 
374 aa  52.4  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
373 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  28.78 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  26.97 
 
 
396 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  28.28 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  32.38 
 
 
616 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  45.9 
 
 
384 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.55 
 
 
562 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  26.75 
 
 
405 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
785 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  34.21 
 
 
364 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  42.5 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
821 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  45 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  31.91 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  40.51 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.72 
 
 
562 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  37.18 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  29.51 
 
 
310 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.56 
 
 
405 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  25.27 
 
 
257 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>