170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1447 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  100 
 
 		 430 aa  860    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  53.14 
 
 		 474 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  39.1 
 
 		 444 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  39.26 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03600  L-fucose: permease  42.45 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1833  L-fucose transporter  37.07 
 
 		 644 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  39.42 
 
 		 448 aa  279  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  37.83 
 
 		 411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  41.6 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  36.41 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  33.41 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.94 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  32.31 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  32.31 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  32.31 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  32.31 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  32.31 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  35.75 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  32.08 
 
 		 438 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  34.49 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  33.49 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  32.63 
 
 		 438 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  33.72 
 
 		 457 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  32.63 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  32.63 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  33.72 
 
 		 457 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  32.63 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  32.63 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  33.18 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  33.02 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  32.44 
 
 		 443 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  34.05 
 
 		 417 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  32.79 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.9 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  31.44 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  31.29 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  34.58 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.13 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  31.72 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4123  L-fucose:H+ symporter permease  32.39 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4002  L-fucose:H+ symporter permease  32.39 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4073  L-fucose:H+ symporter permease  32.39 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4018  L-fucose:H+ symporter permease  32.39 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4181  L-fucose:H+ symporter permease  32.39 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  33.41 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  29.04 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  30.07 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  28.67 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  32.16 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  28.27 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  29.67 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0406  L-fucose transporter  30.38 
 
 		 451 aa  192  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00228439  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  29.43 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  29.43 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  29.43 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  29.43 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  27.46 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  30.07 
 
 		 440 aa  189  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  29.16 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  28.92 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  28.92 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  27.31 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  28.37 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  29.95 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  28.12 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  30.14 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  32.91 
 
 		 418 aa  183  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  32.66 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  30.05 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  29.67 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  27.01 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  28.54 
 
 		 437 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  29.51 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  31.9 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  28.4 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  27.68 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  28.23 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  30.14 
 
 		 407 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  28.19 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  28.98 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  28.54 
 
 		 421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  27.55 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 		 468 aa  170  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  27.8 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  30.37 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  28.67 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1420  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.63 
 
 		 471 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  27.4 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  28.25 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  26.42 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  28.87 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  27.4 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  27 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  30.19 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  28.37 
 
 		 403 aa  149  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  27.88 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58479  L-fucose permease Glucose/galactose transporter  29.15 
 
 		 372 aa  147  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  27.04 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  28.05 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>