132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1428 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1428  permease  100 
 
 		 265 aa  521  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02500  predicted inner membrane protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.048331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1063  cytochrome c assembly protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02464  hypothetical protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0370315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3850  putative cytochrome C assembly protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000010196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2770  putative cytochrome C assembly protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000534415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2895  putative cytochrome C assembly protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1072  cytochrome c assembly protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  normal  0.0177644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2763  putative cytochrome C assembly protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0166622  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3000  putative cytochrome C assembly protein  42.42 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000509297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3231  putative cytochrome C assembly protein  44.18 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  44.18 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  44.18 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0850  cytochrome c assembly protein  41.06 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00175266  hitchhiker  0.0000187767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  38.78 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2862  cytochrome c assembly protein  41.38 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3092  cytochrome c assembly protein  42.11 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000526591  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1122  cytochrome c assembly protein  40.23 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0765442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3205  cytochrome c assembly protein  40.23 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00378275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  40.68 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  39.54 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0647  inner membrane protein, putative cytochrome c assembly protein  39.02 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.650824  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0989  cytochrome c assembly protein  42.15 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00443363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  38.64 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  42.06 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  40.68 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  40.6 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  38.81 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  39.1 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  39.55 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  40.23 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  39.16 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  39.85 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2840  cytochrome c assembly protein  40.23 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000354809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2922  cytochrome c assembly protein  40.23 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  40.6 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  39.85 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1252  cytochrome c assembly protein  39.85 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1285  cytochrome c assembly protein  39.85 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000446299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  37.36 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  41.06 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4075  cytochrome C assembly family protein  38.61 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  32.49 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  37.79 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  33.85 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  35.62 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  30.58 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  30.17 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  36.78 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  34.56 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  34.56 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  34.56 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  34.56 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  37.5 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  32.91 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  37.59 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  31.93 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  37.23 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  32.5 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  36.5 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  40.5 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  32.35 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  32.6 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  27.44 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  36.43 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  34.67 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  35.04 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  37.11 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  37.59 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  31.25 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  30.92 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  36.96 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  37.58 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  32.69 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  36.94 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  34.87 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  33.79 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  33.59 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  31.33 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  31.33 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  31.41 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  35 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  30.43 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  29.25 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  33.86 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  32.28 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  28.84 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0869  cytochrome c assembly protein  32.65 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  31.79 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  31.79 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  36.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  36.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  36.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  36.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  36.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  36.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  36.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>