More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1344 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  100 
 
 		 107 aa  220  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  66.02 
 
 		 108 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  62.62 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  62.62 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  62.62 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  62.62 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  62.62 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  62.62 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  62.62 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  61.68 
 
 		 108 aa  147  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  61.68 
 
 		 108 aa  147  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  61.68 
 
 		 108 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  61.68 
 
 		 108 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  61.68 
 
 		 108 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  61.68 
 
 		 108 aa  147  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  61.68 
 
 		 108 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  63.11 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  60.75 
 
 		 108 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  61.68 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  61.9 
 
 		 108 aa  146  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  60.75 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  59.81 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  59.81 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  58.88 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  58.88 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  59.22 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  57.28 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  58.88 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  58.88 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  59.22 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  58.88 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  56.73 
 
 		 108 aa  139  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  57.01 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  57.28 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  58.88 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  57.43 
 
 		 106 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  58.1 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  58.42 
 
 		 104 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  57.28 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  55.77 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  57.28 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  55.34 
 
 		 109 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  56.07 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  55.14 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  63.54 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  57.43 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  53.4 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  55.14 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  63.54 
 
 		 106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  63.54 
 
 		 106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  56.07 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  50.49 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  54.37 
 
 		 110 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  54.46 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  54.21 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  54.29 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  55.14 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  54.29 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  55.88 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  51.4 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  52.94 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  54.46 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  54.21 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  54.29 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  54.46 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  51.4 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  54.81 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  54.29 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  54.29 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  51.96 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  52.88 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  52.83 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  52.83 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  60.2 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  52.88 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  52.83 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  59.38 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  53.85 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  53.4 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  51.46 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  52.88 
 
 		 109 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>