More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1296 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  42.55 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  44.26 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  45.49 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  45.49 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  45.49 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  42.19 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  41.15 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  41.7 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  41.6 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  42.13 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.7 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  41.7 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  41.7 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  41.7 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  41.7 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  41.7 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  42.13 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  40.85 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  39.26 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  42.24 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  36.63 
 
 		 240 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  40.76 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  36.64 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  38.31 
 
 		 251 aa  164  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  38.03 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  39.92 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  37.34 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  37.82 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  37.82 
 
 		 238 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  37.82 
 
 		 238 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  37.82 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  39.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  34.87 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  37.71 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  37.29 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  38.66 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  36.1 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  36.05 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  36.51 
 
 		 248 aa  148  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  34.19 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  34.85 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  34.75 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  36.99 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  35.39 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  32.57 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  33.61 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  35.59 
 
 		 220 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  33.76 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  34.59 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  30 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  27.08 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  29.49 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  30.63 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  27.07 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  25.33 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  30.19 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  25.33 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  26.64 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  25.76 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  24.68 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  24.68 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.27 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  25.11 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  25.11 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  25.11 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  25.76 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  25.75 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  30 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  31.45 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.54 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  26.2 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  26.64 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  23.53 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  26.54 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  31.52 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  24.9 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  29.19 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  24.32 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  23.71 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  28.67 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  29.45 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  25.79 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  29.93 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  28.12 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  25.16 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  25.55 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.19 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  24.88 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  23.48 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  23.48 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  23.87 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  22.88 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.27 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  36.14 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>