154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1154 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  48.26 
 
 
2851 aa  785    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  100 
 
 
3554 aa  7023    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  35.97 
 
 
2906 aa  627  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  43.63 
 
 
5143 aa  618  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  62.92 
 
 
4238 aa  589  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  58.53 
 
 
3078 aa  531  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  36.75 
 
 
2075 aa  438  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  33.27 
 
 
2073 aa  422  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  36.14 
 
 
2078 aa  420  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  36.44 
 
 
2092 aa  418  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  36.54 
 
 
1813 aa  413  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  34.65 
 
 
2078 aa  406  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  42.8 
 
 
4526 aa  406  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  35 
 
 
2091 aa  400  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  32.19 
 
 
3737 aa  379  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  45.3 
 
 
2914 aa  341  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  32.1 
 
 
3920 aa  271  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  37.78 
 
 
209 aa  131  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  27.76 
 
 
1516 aa  104  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  47.62 
 
 
1014 aa  97.1  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  28.07 
 
 
2868 aa  93.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  31.27 
 
 
1333 aa  89.4  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  27.22 
 
 
4384 aa  89  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  43.15 
 
 
2504 aa  87.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  41.78 
 
 
1390 aa  85.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  42.33 
 
 
1190 aa  85.5  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  48.35 
 
 
998 aa  84.3  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  43.12 
 
 
1440 aa  83.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  27.95 
 
 
599 aa  80.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  37.58 
 
 
1405 aa  80.9  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  28.07 
 
 
1068 aa  79  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  36.87 
 
 
551 aa  78.2  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.15 
 
 
877 aa  77.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.31 
 
 
1230 aa  76.6  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 
831 aa  75.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 
831 aa  75.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 
820 aa  75.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 
816 aa  75.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 
816 aa  75.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 
816 aa  75.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 
816 aa  75.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  28.63 
 
 
827 aa  73.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  27.32 
 
 
2396 aa  73.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  26.23 
 
 
1472 aa  73.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  43.53 
 
 
810 aa  73.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  27.31 
 
 
2095 aa  73.6  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  26.4 
 
 
737 aa  73.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  41.6 
 
 
1065 aa  72.4  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  24.54 
 
 
1072 aa  72.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  38.38 
 
 
1447 aa  71.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  27.29 
 
 
617 aa  72  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  38.38 
 
 
1342 aa  71.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  38.38 
 
 
1447 aa  72  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  28.97 
 
 
962 aa  72.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  39 
 
 
1616 aa  71.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  38.38 
 
 
1446 aa  71.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  39 
 
 
1616 aa  71.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  41.86 
 
 
279 aa  71.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  28.99 
 
 
386 aa  71.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  41.38 
 
 
1588 aa  71.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  29.27 
 
 
1186 aa  71.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  39 
 
 
1616 aa  71.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  41.38 
 
 
1674 aa  71.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  39 
 
 
1549 aa  70.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  29.96 
 
 
600 aa  70.5  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  43.52 
 
 
3635 aa  70.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  46.77 
 
 
472 aa  70.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  36.62 
 
 
3126 aa  70.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  25.05 
 
 
1117 aa  70.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  30.47 
 
 
1259 aa  69.7  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  28.33 
 
 
691 aa  69.7  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  45 
 
 
4726 aa  69.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  30 
 
 
565 aa  67.8  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  44.87 
 
 
716 aa  67.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  44.87 
 
 
716 aa  67  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  28.73 
 
 
3355 aa  67  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  39.81 
 
 
492 aa  63.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  28.65 
 
 
1613 aa  64.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  27.48 
 
 
2866 aa  63.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  27.84 
 
 
575 aa  62.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  28.14 
 
 
4191 aa  63.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  40 
 
 
1713 aa  62  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  31.36 
 
 
597 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  31.36 
 
 
597 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  40 
 
 
1235 aa  62  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  28.4 
 
 
1411 aa  61.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  43 
 
 
356 aa  61.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  31.36 
 
 
597 aa  61.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  47.19 
 
 
990 aa  61.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  40.51 
 
 
452 aa  60.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  27.24 
 
 
753 aa  60.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  26.96 
 
 
404 aa  60.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  26.99 
 
 
878 aa  60.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  29.65 
 
 
3718 aa  60.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  27.71 
 
 
1265 aa  59.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  30.62 
 
 
1451 aa  59.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  39.18 
 
 
305 aa  59.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  59.26 
 
 
563 aa  59.3  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  28.72 
 
 
2493 aa  58.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  26.93 
 
 
2392 aa  58.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>