123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1121 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  67.14 
 
 		 144 aa  206  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  66.43 
 
 		 145 aa  205  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  66.43 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  66.43 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  66.43 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  66.43 
 
 		 144 aa  204  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  65 
 
 		 148 aa  203  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  66.43 
 
 		 144 aa  203  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  66.43 
 
 		 145 aa  203  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  65.71 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  53.24 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  53.24 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  51.8 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  50.36 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  38.85 
 
 		 189 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  46.43 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  37.41 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  41.13 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  39.29 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  32.87 
 
 		 148 aa  91.3  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  34.72 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  30.66 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  39.57 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  31.16 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  34.06 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  34.06 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  34.06 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  34.06 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  34.06 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  30.43 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  28.99 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  29.71 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  29.71 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  29.71 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  29.71 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  29.71 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  29.71 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  29.71 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  32.85 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  29.66 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  29.66 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.28 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  25.55 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  27.66 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2982  hypothetical protein  25.36 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 265 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  25.52 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  27.46 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  29.17 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.46 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 289 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  23.84 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  26.9 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  27.74 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  28.08 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  55.26 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  55.26 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  31.09 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  29.93 
 
 		 283 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  26.03 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  26.42 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  26.62 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  27.74 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>