More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1093 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.97 
 
 		 474 aa  852    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.97 
 
 		 474 aa  852    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.53 
 
 		 475 aa  805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.97 
 
 		 474 aa  852    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.34 
 
 		 474 aa  849    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4805  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.12 
 
 		 477 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03462  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.32 
 
 		 476 aa  832    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.53 
 
 		 475 aa  807    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.37 
 
 		 475 aa  815    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.09 
 
 		 473 aa  702    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.34 
 
 		 474 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.34 
 
 		 474 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.47 
 
 		 475 aa  803    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.97 
 
 		 495 aa  852    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.37 
 
 		 475 aa  812    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.95 
 
 		 475 aa  810    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.24 
 
 		 476 aa  821    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.74 
 
 		 475 aa  808    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.65 
 
 		 474 aa  839    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.65 
 
 		 475 aa  839    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2925  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.64 
 
 		 474 aa  773    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.34 
 
 		 475 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.16 
 
 		 475 aa  813    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  88 
 
 		 475 aa  861    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.09 
 
 		 476 aa  793    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.08 
 
 		 474 aa  844    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.08 
 
 		 474 aa  836    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.16 
 
 		 475 aa  813    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.72 
 
 		 476 aa  798    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.5 
 
 		 474 aa  847    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.53 
 
 		 475 aa  807    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.55 
 
 		 474 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.76 
 
 		 474 aa  850    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.97 
 
 		 495 aa  852    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.65 
 
 		 474 aa  839    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.65 
 
 		 474 aa  832    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.71 
 
 		 474 aa  837    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.79 
 
 		 474 aa  734    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.84 
 
 		 475 aa  832    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.97 
 
 		 474 aa  852    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 474 aa  961    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.16 
 
 		 475 aa  813    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  83.16 
 
 		 475 aa  813    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.97 
 
 		 474 aa  852    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.46 
 
 		 476 aa  790    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.13 
 
 		 474 aa  853    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002552  dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase complex  85.05 
 
 		 475 aa  834    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0510  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  62.55 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0251745  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3247  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.62 
 
 		 595 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 		 588 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 		 588 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 		 590 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.85 
 
 		 685 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4916  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.62 
 
 		 595 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 		 588 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2172  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 		 588 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6503  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.32 
 
 		 592 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120205  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  62.79 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  62.79 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 		 589 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 		 592 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  62.79 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  62.79 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  62.79 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  63 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  62.79 
 
 		 589 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  62.79 
 
 		 589 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1866  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  63.48 
 
 		 589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.18 
 
 		 593 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00163952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  63 
 
 		 603 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.26 
 
 		 625 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.66 
 
 		 474 aa  595  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.51 
 
 		 680 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1944  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.18 
 
 		 593 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0868874  hitchhiker  0.000336212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  62.11 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  62.11 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  63.66 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.65 
 
 		 599 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.06 
 
 		 619 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.08 
 
 		 588 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0736  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.71 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.871473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1199  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.72 
 
 		 592 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000025561  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.41 
 
 		 594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1086  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.71 
 
 		 587 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0812203  normal  0.813461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.67 
 
 		 591 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1306  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.72 
 
 		 593 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1966  dihydrolipoyl dehydrogenase  62 
 
 		 580 aa  564  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258169  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.75 
 
 		 602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1603  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.42 
 
 		 594 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00100727  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5336  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.3 
 
 		 590 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.97 
 
 		 605 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.58 
 
 		 607 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.33 
 
 		 603 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.75 
 
 		 579 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.14 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.13 
 
 		 603 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 		 589 aa  543  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  58.41 
 
 		 473 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.99 
 
 		 593 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.99 
 
 		 593 aa  534  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>