59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1092 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1092  ImpA protein  100 
 
 		 151 aa  310  3.9999999999999997e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00223714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  29.91 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  29.91 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  29.91 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  29.91 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  26.32 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  24.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  24.07 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  23.44 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  23.44 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  23.44 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  28.16 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  28.71 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  25 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  25 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  29.25 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  25.23 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  24.04 
 
 		 212 aa  52.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  25.23 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  21.9 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  23.08 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  28.43 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  25.71 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  28.43 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  19.05 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  28.74 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  28.83 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  28.83 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  25.71 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  23 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  23.81 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  25.24 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  27.36 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  26.21 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  24.3 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  24.78 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2517  peptidase S24 and S26 domain protein  23.36 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983902  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  23.15 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2469  putative prophage repressor  21.62 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.244846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  25.24 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4974  peptidase S24 and S26 domain protein  23.81 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  25.24 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  20.59 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  25.24 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  20.75 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.41 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  26.67 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  16.19 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  22.86 
 
 		 243 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  27.94 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  24.53 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>