148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1058 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1058  large adhesin  100 
 
 		 2906 aa  5688    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  36.03 
 
 		 3554 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  54.85 
 
 		 4526 aa  427  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  49.06 
 
 		 3078 aa  417  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  63.64 
 
 		 5143 aa  400  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  32.51 
 
 		 2078 aa  339  3.9999999999999995e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  31.1 
 
 		 2073 aa  325  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  43.99 
 
 		 3737 aa  321  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  31.5 
 
 		 1813 aa  320  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  42.77 
 
 		 4238 aa  276  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  29.13 
 
 		 2078 aa  258  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  38.7 
 
 		 2851 aa  236  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  41.47 
 
 		 2914 aa  212  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  34.23 
 
 		 2092 aa  210  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  33.27 
 
 		 2075 aa  204  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  34.5 
 
 		 2091 aa  199  9e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  34.8 
 
 		 3920 aa  177  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  43.51 
 
 		 209 aa  112  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1714  hypothetical protein  38.91 
 
 		 891 aa  106  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  33.44 
 
 		 1014 aa  105  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.76 
 
 		 4726 aa  92.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  43.48 
 
 		 1516 aa  86.7  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  32.36 
 
 		 691 aa  86.3  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  43.75 
 
 		 1616 aa  84.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  43.75 
 
 		 1588 aa  84.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  43.75 
 
 		 1674 aa  84.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  43.75 
 
 		 1616 aa  84.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1616 aa  84.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  40.43 
 
 		 1472 aa  84.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  40.43 
 
 		 1447 aa  84.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  43.75 
 
 		 1549 aa  84.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  40.43 
 
 		 1447 aa  84  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  40.43 
 
 		 1446 aa  84  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  43.75 
 
 		 279 aa  83.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  40.43 
 
 		 1342 aa  84  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.06 
 
 		 3635 aa  83.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  47.62 
 
 		 1259 aa  82.4  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  40.88 
 
 		 1405 aa  81.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  25.46 
 
 		 827 aa  80.5  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  45.19 
 
 		 1190 aa  79.7  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  45.19 
 
 		 1440 aa  79.7  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  44.58 
 
 		 877 aa  79.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  44.58 
 
 		 810 aa  78.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  27.27 
 
 		 2868 aa  78.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1311  hypothetical protein  24.01 
 
 		 697 aa  77.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00222166  hitchhiker  0.000000478803 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  38.37 
 
 		 2504 aa  77.4  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  41.75 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  29.5 
 
 		 599 aa  75.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  47.27 
 
 		 1390 aa  75.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  39.47 
 
 		 551 aa  75.1  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  41.75 
 
 		 716 aa  75.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  51.61 
 
 		 472 aa  74.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  42.71 
 
 		 1713 aa  73.6  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  29.61 
 
 		 2396 aa  73.2  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  33.11 
 
 		 762 aa  72  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  28.51 
 
 		 1230 aa  72.8  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  33.73 
 
 		 600 aa  71.6  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  28.06 
 
 		 3718 aa  72  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  48.28 
 
 		 4384 aa  70.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  41.38 
 
 		 492 aa  70.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  35.23 
 
 		 2095 aa  69.7  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  39.64 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  30 
 
 		 1613 aa  69.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  34.55 
 
 		 753 aa  68.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  28.34 
 
 		 735 aa  68.6  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  33.93 
 
 		 1204 aa  68.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  30.48 
 
 		 878 aa  68.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  26.89 
 
 		 617 aa  67.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  26.59 
 
 		 4191 aa  67.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  25.98 
 
 		 1411 aa  67  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  36.31 
 
 		 1333 aa  66.6  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  41.18 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  39.08 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  39.08 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  39.08 
 
 		 597 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  33.04 
 
 		 1125 aa  65.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  31.53 
 
 		 1197 aa  65.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  24.95 
 
 		 1117 aa  65.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  31.53 
 
 		 1197 aa  65.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  42.71 
 
 		 356 aa  65.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  31.53 
 
 		 1197 aa  65.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  32.43 
 
 		 1451 aa  64.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  41.18 
 
 		 305 aa  64.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  42.7 
 
 		 1235 aa  64.3  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1512  hypothetical protein  41.18 
 
 		 362 aa  63.5  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  31.23 
 
 		 998 aa  63.5  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  33.51 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  32.06 
 
 		 3192 aa  61.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  50 
 
 		 990 aa  61.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.83 
 
 		 816 aa  60.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.83 
 
 		 820 aa  60.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.83 
 
 		 816 aa  60.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.83 
 
 		 816 aa  60.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.83 
 
 		 816 aa  60.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  36.67 
 
 		 831 aa  60.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  36.67 
 
 		 831 aa  60.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  36.67 
 
 		 831 aa  60.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  33.19 
 
 		 2277 aa  59.7  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  29.6 
 
 		 418 aa  58.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  34.88 
 
 		 1916 aa  58.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>