51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1019 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1019  permease  100 
 
 		 433 aa  862    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  50.82 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  53.37 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  53.35 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  52.44 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  50.24 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  48.23 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  51.15 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  48.23 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  46.9 
 
 		 421 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  47.01 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  45.08 
 
 		 424 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  47.92 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  47.29 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  48.03 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  47.26 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  45.13 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  47.51 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  47.26 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  47.76 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  47.51 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  47.26 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  46.86 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  44.5 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  37.77 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  35.52 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  39.28 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  38.19 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  37.32 
 
 		 434 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  36.75 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  36.75 
 
 		 437 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  36.75 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  34.05 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  37.08 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  32.85 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  33.33 
 
 		 427 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  37.47 
 
 		 460 aa  203  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  35 
 
 		 431 aa  199  9e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  32.2 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  25.5 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  28.18 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  26.28 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  28.21 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  29.33 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  25.17 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  59.38 
 
 		 52 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.44 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  28.57 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  23.26 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  22.81 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  29.44 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>