More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1012 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 514 aa  1024    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  42.48 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  42.91 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  42.71 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  42.31 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  42.51 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  42.71 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  42.09 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  42.71 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  42.71 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  42.71 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  42.09 
 
 		 536 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  42.09 
 
 		 536 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  42.09 
 
 		 536 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  42.09 
 
 		 536 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  42.45 
 
 		 535 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  42.45 
 
 		 535 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 		 536 aa  362  8e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  42.45 
 
 		 535 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  42.72 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  40.73 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  40.47 
 
 		 516 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  41.62 
 
 		 535 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  40.83 
 
 		 535 aa  343  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  40.7 
 
 		 530 aa  339  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  44.47 
 
 		 537 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  44.47 
 
 		 536 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  39.49 
 
 		 534 aa  333  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  39.47 
 
 		 540 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  38.1 
 
 		 543 aa  306  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  38.04 
 
 		 541 aa  289  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  35.9 
 
 		 531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  37.5 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  40.65 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  36.42 
 
 		 542 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  34.79 
 
 		 523 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  32.09 
 
 		 504 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  30.22 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  31.28 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  29.78 
 
 		 504 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.41 
 
 		 550 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.13 
 
 		 565 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.66 
 
 		 515 aa  98.2  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.82 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.23 
 
 		 544 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  22.7 
 
 		 576 aa  90.5  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.14 
 
 		 606 aa  86.7  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.9 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.64 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 		 564 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.21 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  22.25 
 
 		 551 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 		 560 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  22.09 
 
 		 547 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  30.56 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0857  ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.020364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1902  PhnU  27.75 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2052  ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.667193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0586  ABC-type sulfate transport system, permease component  27.75 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0898  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00123492  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 		 528 aa  73.6  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0489  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1760  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2214  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.201652  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 226 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 226 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 226 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 226 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  28.77 
 
 		 223 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.19 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  19.96 
 
 		 592 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  28.51 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 		 225 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.45 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.77 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3425  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  25.59 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0399054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.89 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.36 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.36 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.83 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.09 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0836  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.95 
 
 		 222 aa  67  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0782  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.69 
 
 		 217 aa  67  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1449  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.08 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.847792 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.69 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.11 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  24.88 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.1 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.49 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.53 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1873  ABC transporter, inner membrane subunit  27.94 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0965334  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.93 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.04 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.24 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>