More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1011 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  58.74 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  57.97 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  58.45 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  57.97 
 
 		 236 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  56.52 
 
 		 237 aa  234  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  52.66 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  52.66 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  56.52 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  56.52 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  56.52 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 		 235 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.66 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.17 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.051764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  52.17 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.17 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  51.69 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  50.96 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  53.48 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  49.28 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  49.5 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  47.83 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  48.06 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.6 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  46.67 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 		 258 aa  174  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  46.77 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 249 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  42.21 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  42.21 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 		 382 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 377 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 342 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.64 
 
 		 360 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  41.71 
 
 		 367 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  40.51 
 
 		 357 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.46 
 
 		 378 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.21 
 
 		 402 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.51 
 
 		 373 aa  158  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  40.67 
 
 		 355 aa  158  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 		 370 aa  157  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 		 368 aa  157  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  42.03 
 
 		 367 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 367 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  42.56 
 
 		 339 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  41.71 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 		 373 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 		 354 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  43.75 
 
 		 351 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  43.43 
 
 		 359 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  40 
 
 		 370 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 		 377 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 		 387 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  39.79 
 
 		 350 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  43.37 
 
 		 527 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  41.62 
 
 		 356 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.64 
 
 		 388 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2848  ABC transporter related protein  40.84 
 
 		 367 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.64 
 
 		 388 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.93 
 
 		 357 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.64 
 
 		 388 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  42.35 
 
 		 342 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  40.87 
 
 		 363 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.97 
 
 		 375 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 378 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 		 354 aa  154  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 372 aa  154  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.2 
 
 		 423 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  42.64 
 
 		 381 aa  154  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 381 aa  154  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 		 375 aa  154  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 400 aa  154  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  41.27 
 
 		 354 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 368 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 377 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 377 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  38.69 
 
 		 382 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.93 
 
 		 380 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 		 371 aa  153  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 		 378 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 377 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.08 
 
 		 380 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  40.91 
 
 		 371 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 377 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3470  ABC transporter related  45.5 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.27 
 
 		 361 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  41.12 
 
 		 368 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 377 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1576  ABC transporter related  40.78 
 
 		 381 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 		 378 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  45.03 
 
 		 342 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>