113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0973 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0973  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 398 aa  819    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000517245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1915  tetratricopeptide repeat protein  46.1 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000481977  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2234  tetratricopeptide repeat protein  46.1 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215898  hitchhiker  0.00382092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2026  tetratricopeptide repeat protein  46.1 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000487285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2650  tetratricopeptide repeat protein  45.88 
 
 		 389 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174406  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01257  hypothetical protein  45.34 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000160117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  45.34 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000651113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  45.34 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1482  tetratricopeptide repeat protein  45.34 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  45.34 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000129079  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  45.34 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  45.34 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  45.34 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01268  hypothetical protein  45.34 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000197215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  46.72 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2641  tetratricopeptide repeat protein  44.3 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1702  tetratricopeptide repeat protein  45.34 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000418527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1735  tetratricopeptide repeat protein  44.56 
 
 		 389 aa  359  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2367  tetratricopeptide repeat protein  44.82 
 
 		 389 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2188  tetratricopeptide repeat protein  43.01 
 
 		 389 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000146225  hitchhiker  0.0000569887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1895  tetratricopeptide repeat protein  45.08 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000228715  hitchhiker  4.98218e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1832  tetratricopeptide repeat protein  45.08 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00100254  unclonable  2.05101e-30 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1837  tetratricopeptide repeat protein  45.08 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000022719  hitchhiker  0.000343343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1441  tetratricopeptide repeat protein  45.08 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000153911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1622  tetratricopeptide repeat protein  45.08 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000649442  decreased coverage  2.66656e-22 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  44.44 
 
 		 391 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  43.41 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000811789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  42.11 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  38.64 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  38.38 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  38.38 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  38.38 
 
 		 386 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  37.63 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  38.07 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 386 aa  276  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  37.63 
 
 		 386 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  38.64 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  36.62 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  36.87 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  39.35 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1756  tetratricopeptide repeat protein  38.23 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000020151  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  36.11 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  36.11 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000283744  hitchhiker  0.000000379293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  37.03 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  34.26 
 
 		 389 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  34.01 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2338  tetratricopeptide repeat protein  32.75 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00445466  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  33.08 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  33.08 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  32.3 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  31.96 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  32.14 
 
 		 392 aa  205  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  31.75 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  32.66 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  32.05 
 
 		 392 aa  195  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  31.03 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  31.54 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  32.34 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2154  tetratricopeptide repeat protein  32.57 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0571  tetratricopeptide repeat protein  30.77 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1050  tetratricopeptide repeat protein  30.77 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  30.51 
 
 		 390 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1009  tetratricopeptide repeat protein  30.51 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0926  tetratricopeptide repeat protein  30.51 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  29.1 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  28.99 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0930  tetratricopeptide repeat protein  30.57 
 
 		 390 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  30.03 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  29.1 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  29.16 
 
 		 408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  28.28 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  28.28 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0424  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2990  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2568  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0943  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2879  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2942  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0205  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1641  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0959  tetratricopeptide repeat protein  28.86 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  28.77 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1283  tetratricopeptide repeat protein  27.82 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95391  normal  0.767339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2138  tetratricopeptide repeat protein  30.33 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00930218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1410  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0344069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1030  tetratricopeptide repeat protein  28.31 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  26.79 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  24.64 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  25.12 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  24.88 
 
 		 424 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0967  tetratricopeptide repeat protein  28.28 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  26.43 
 
 		 409 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  25.19 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4727  tetratricopeptide repeat protein  27.41 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.841453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0502  tetratricopeptide repeat protein  26 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.914976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2472  tetratricopeptide repeat protein  26.46 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.3368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1388  tetratricopeptide repeat protein  25.85 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0712872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>