184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0966 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0966  nuclease  100 
 
 		 185 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  37.43 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  39.08 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  44.72 
 
 		 153 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  41.72 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  36.6 
 
 		 153 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  39.35 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  35.26 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  38.27 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  39.86 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  42.31 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  39.24 
 
 		 153 aa  104  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  39.22 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.09 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  33.95 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  37.87 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  41.55 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  35.95 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  34.81 
 
 		 232 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  35.19 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  39.1 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  36.03 
 
 		 216 aa  98.6  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.71 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.39 
 
 		 164 aa  98.2  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  35.86 
 
 		 238 aa  97.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  37.24 
 
 		 244 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.84 
 
 		 138 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  33.52 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  36.78 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  35.4 
 
 		 205 aa  94.7  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.46 
 
 		 175 aa  94.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  37.5 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.46 
 
 		 193 aa  94.4  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  35.85 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  35.67 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  39.53 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  37.25 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  39.33 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  34.78 
 
 		 175 aa  91.3  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  37.06 
 
 		 158 aa  91.3  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  33.94 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  34.16 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  34.35 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  34.78 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  39.71 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  33.93 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  35.62 
 
 		 208 aa  89  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  34.13 
 
 		 227 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.21 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.06 
 
 		 167 aa  87.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.81 
 
 		 161 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  32.59 
 
 		 221 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  35.51 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.88 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  34.03 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  27.16 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  36.69 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  34.31 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  38.06 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  33.81 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  37.14 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  28.85 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  28.97 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.58 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.82 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.92 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  30.06 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  27.81 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  29.28 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.08 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  31.33 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  26.88 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  31.75 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  32.54 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  29.92 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  31.75 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.59 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.59 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  31.43 
 
 		 351 aa  61.2  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.01 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  31.08 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  34.38 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  29.32 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  30.2 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  33.08 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  31.21 
 
 		 534 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  32.56 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  30.56 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  27.45 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  30.28 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  29.08 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  30.28 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  31.78 
 
 		 350 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>