21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0936 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0936  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  518  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.792793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003217  hypothetical protein  74.1 
 
 
251 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0937  hypothetical protein  64.92 
 
 
248 aa  324  8.000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4801  hypothetical protein  36.67 
 
 
273 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.472026  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03360  hypothetical protein  36.07 
 
 
256 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000516345  unclonable  5.57606e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03370  hypothetical protein  30.74 
 
 
332 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  6.16772e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0011  hypothetical protein  30.47 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0010  hypothetical protein  30.08 
 
 
237 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.642715  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3644  hypothetical protein  29.69 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0012  hypothetical protein  29.69 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0011  hypothetical protein  29.69 
 
 
237 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0012  hypothetical protein  29.69 
 
 
237 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.242726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3585  protein of unknown function UPF0174  29.69 
 
 
237 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00011  hypothetical protein  29.69 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00011  hypothetical protein  29.69 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0010  hypothetical protein  32.08 
 
 
237 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0010  hypothetical protein  32.08 
 
 
237 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0010  hypothetical protein  32.08 
 
 
237 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.503351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0010  hypothetical protein  32.08 
 
 
237 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0398298  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0010  hypothetical protein  32.08 
 
 
237 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0202252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1808  hypothetical protein  27.94 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>