123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0808 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0808  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1008  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.30893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
239 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1142  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
236 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  32.16 
 
 
247 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3137  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
236 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  34.82 
 
 
240 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  34.82 
 
 
240 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  34.82 
 
 
240 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  34.82 
 
 
240 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0747  methyltransferase type 11  32.07 
 
 
238 aa  99  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  31.8 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.63 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3395  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  33.63 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  33.63 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  33.63 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  33.63 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  33.63 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  33.93 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0226  putative methyltransferase  33.63 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.306208  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01982  SAM-dependent methyltransferase  28.21 
 
 
297 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0899928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  30.26 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  27.91 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  30.26 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  89  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  26.56 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  28 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1990  hypothetical protein  31.69 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000251541  hitchhiker  0.00000167474 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175678  decreased coverage  0.0000300845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2206  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2160  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000564941  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2237  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000104202  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2562  hypothetical protein  30.6 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2113  hypothetical protein  30.41 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159353  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2610  hypothetical protein  30.3 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000632095  normal  0.867129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2368  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  normal  0.0100279 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  28.88 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  32.62 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  25.4 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  31.55 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2405  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000054143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  28.41 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  27.07 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  31.25 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  32.08 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  28.98 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  36.44 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  37.11 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
274 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
270 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
271 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 
272 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  29.91 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  34.19 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  31.07 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  34.31 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1943  methyltransferase type 11  25.55 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  30.63 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  34.74 
 
 
294 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 
281 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  25.45 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  25.45 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  36.21 
 
 
236 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  36.21 
 
 
236 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  36.21 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.34 
 
 
277 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  36.21 
 
 
236 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>