More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0792 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  100 
 
 
396 aa  802    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  35.96 
 
 
393 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  35.96 
 
 
393 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 
393 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  33.6 
 
 
386 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
391 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  32.64 
 
 
386 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 
393 aa  253  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  37.7 
 
 
390 aa  252  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  32.11 
 
 
394 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  34.49 
 
 
383 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  34.49 
 
 
383 aa  242  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  34.76 
 
 
383 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  34.76 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  34.76 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  34.32 
 
 
383 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  34.49 
 
 
383 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  34.49 
 
 
383 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  33.96 
 
 
383 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 
409 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  33.68 
 
 
383 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  33.96 
 
 
383 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
391 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  30.63 
 
 
400 aa  229  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  29.95 
 
 
386 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  34.03 
 
 
397 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  33.16 
 
 
404 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 
401 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  27.74 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  31.28 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 
393 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
393 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
391 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  31.85 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  28.68 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  31.35 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
384 aa  212  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  28.01 
 
 
381 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  30.83 
 
 
392 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 
390 aa  210  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  29.35 
 
 
393 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  31.89 
 
 
397 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  32.1 
 
 
386 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  25.78 
 
 
393 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 
521 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  29.27 
 
 
390 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  28.91 
 
 
385 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  29.09 
 
 
389 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  28.91 
 
 
390 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  31.61 
 
 
387 aa  202  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  30.71 
 
 
383 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 
412 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  30.05 
 
 
390 aa  202  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  29.16 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  27.72 
 
 
390 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  27.82 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  28.46 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 
383 aa  195  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  27.27 
 
 
390 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  27.72 
 
 
390 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  29.69 
 
 
390 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  27.06 
 
 
393 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  29.69 
 
 
390 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  28.87 
 
 
399 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  29.69 
 
 
390 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  29.43 
 
 
390 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  29.43 
 
 
390 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  29.69 
 
 
390 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  29.43 
 
 
390 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  29.43 
 
 
390 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  29.43 
 
 
390 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  27.6 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  27.6 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  28.02 
 
 
392 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  28.02 
 
 
392 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  29.11 
 
 
390 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 
400 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  29.32 
 
 
400 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 
400 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  29.58 
 
 
400 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 
400 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  28.03 
 
 
386 aa  186  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0733  aminotransferase, classes I and II, putative  34.66 
 
 
397 aa  186  7e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10930  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  27.66 
 
 
405 aa  186  8e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34112  unclonable  0.00000000328438 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  30.69 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  25.84 
 
 
396 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  26.23 
 
 
390 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  25.46 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  26.85 
 
 
387 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  29.02 
 
 
389 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  25.78 
 
 
386 aa  179  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  26.36 
 
 
390 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  31.5 
 
 
387 aa  178  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  26.05 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2960  aminotransferase, classes I and II  28.68 
 
 
391 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  28.87 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>