165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0790 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0209  large adhesin  73.89 
 
 
5143 aa  2416    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  100 
 
 
3920 aa  7753    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  49.88 
 
 
3737 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  72.71 
 
 
4526 aa  1209    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  49.22 
 
 
3078 aa  1380    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  37.82 
 
 
4238 aa  385  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  32.36 
 
 
3554 aa  284  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50.79 
 
 
2914 aa  239  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  38.58 
 
 
2091 aa  209  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  32.62 
 
 
2078 aa  206  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  36.11 
 
 
2906 aa  196  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  30.8 
 
 
2075 aa  195  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  38.59 
 
 
2078 aa  189  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  37.27 
 
 
2092 aa  189  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  37.29 
 
 
2073 aa  184  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  42.86 
 
 
1014 aa  183  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  50.92 
 
 
1813 aa  174  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  31.05 
 
 
2851 aa  170  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1185  hypothetical protein  57.94 
 
 
239 aa  129  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00454576  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  27.29 
 
 
1516 aa  99.4  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  29.94 
 
 
691 aa  92  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  29.68 
 
 
827 aa  90.5  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  29.01 
 
 
1230 aa  88.2  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  36.73 
 
 
492 aa  87.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.14 
 
 
1674 aa  87.8  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30.25 
 
 
1616 aa  86.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30.25 
 
 
1616 aa  86.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.25 
 
 
1616 aa  85.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  26.06 
 
 
1411 aa  84.3  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  34.27 
 
 
209 aa  80.9  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  30.51 
 
 
617 aa  79.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.25 
 
 
1588 aa  77.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  30.39 
 
 
2095 aa  76.3  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  30.75 
 
 
1186 aa  75.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  29.51 
 
 
962 aa  75.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  27.27 
 
 
1259 aa  74.7  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  29.37 
 
 
737 aa  73.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  26.04 
 
 
1333 aa  73.6  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  31.19 
 
 
1068 aa  73.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  34.1 
 
 
548 aa  72.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  32.35 
 
 
998 aa  71.6  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  24.1 
 
 
1613 aa  71.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  27.23 
 
 
4191 aa  71.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  27.34 
 
 
650 aa  71.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  33.5 
 
 
1405 aa  70.1  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  35.85 
 
 
1440 aa  69.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  26.1 
 
 
2868 aa  69.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  35.85 
 
 
1190 aa  69.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  32.75 
 
 
1854 aa  68.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  45.05 
 
 
1204 aa  68.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  33.79 
 
 
551 aa  68.6  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  28.68 
 
 
2392 aa  68.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  34.13 
 
 
1447 aa  67.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  34.13 
 
 
1447 aa  67.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  28 
 
 
600 aa  67.8  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  34.13 
 
 
1342 aa  67.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  43.96 
 
 
1451 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  43.96 
 
 
1197 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  43.96 
 
 
1197 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  43.96 
 
 
1125 aa  66.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.22 
 
 
1549 aa  66.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  43.96 
 
 
1197 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  38.1 
 
 
2504 aa  65.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  29.64 
 
 
1471 aa  65.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  29.64 
 
 
1471 aa  65.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  25.63 
 
 
1265 aa  65.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  29.13 
 
 
599 aa  65.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  28.68 
 
 
877 aa  64.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  29.64 
 
 
1546 aa  64.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  29.09 
 
 
601 aa  63.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  27.69 
 
 
2396 aa  63.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  39.22 
 
 
575 aa  63.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  36 
 
 
1390 aa  62.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  39.78 
 
 
589 aa  62.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  35.12 
 
 
1487 aa  62  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  37.76 
 
 
597 aa  61.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  37.76 
 
 
597 aa  61.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  37.76 
 
 
597 aa  61.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  25.43 
 
 
1814 aa  61.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  29.76 
 
 
418 aa  61.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  29.45 
 
 
1235 aa  61.2  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  33.33 
 
 
595 aa  60.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  26.23 
 
 
1446 aa  60.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  32.43 
 
 
386 aa  60.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  33.33 
 
 
452 aa  60.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  29.25 
 
 
1012 aa  60.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1512  hypothetical protein  33.33 
 
 
362 aa  59.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  39.53 
 
 
601 aa  59.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  26.6 
 
 
3718 aa  59.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  34.02 
 
 
305 aa  58.9  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  26.84 
 
 
1434 aa  58.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  33.12 
 
 
536 aa  58.2  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  26.67 
 
 
563 aa  58.5  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  34.92 
 
 
2157 aa  57.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  33.53 
 
 
2141 aa  57.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  29.34 
 
 
404 aa  57.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  32.84 
 
 
279 aa  58.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  26.6 
 
 
3355 aa  57.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  35.38 
 
 
740 aa  57.4  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  25.5 
 
 
565 aa  57.4  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>