More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0763 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3929  ABC transporter-related protein  66.73 
 
 		 517 aa  686    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.992166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0763  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 505 aa  1035    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.831413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3688  ABC transporter related  66.13 
 
 		 509 aa  684    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3885  ABC transporter related protein  66.27 
 
 		 509 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2713  ABC transporter related  49.08 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3343  ABC transporter related  50.1 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589852  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  47.17 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000554602  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4514  ABC transporter related  46.56 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0372056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.49 
 
 		 498 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1593  ABC transporter related  47.03 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  39.76 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.61 
 
 		 496 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.1 
 
 		 497 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  37.52 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.52 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2999  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 515 aa  324  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.776135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  36.61 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.4 
 
 		 514 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  35.69 
 
 		 515 aa  319  7.999999999999999e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  37.97 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  37.4 
 
 		 495 aa  316  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  36.8 
 
 		 503 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  35.69 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  37 
 
 		 499 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  34.95 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  34.94 
 
 		 497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  33 
 
 		 505 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  34.69 
 
 		 501 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 515 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  35.31 
 
 		 515 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  37.07 
 
 		 506 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  35.45 
 
 		 515 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  35.69 
 
 		 506 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 504 aa  309  9e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  37.12 
 
 		 501 aa  309  9e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  36.08 
 
 		 521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  37.94 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  34.62 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  37.53 
 
 		 504 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  36.29 
 
 		 492 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  35.1 
 
 		 499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  35.13 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.45 
 
 		 506 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  36.29 
 
 		 492 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  33.81 
 
 		 501 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  37.15 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  33.81 
 
 		 501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  35.09 
 
 		 503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  36.31 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  34.54 
 
 		 520 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  36.85 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  36.69 
 
 		 517 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  35.77 
 
 		 509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  37.58 
 
 		 508 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  36.38 
 
 		 501 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  36.77 
 
 		 511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3093  ABC transporter related  36.38 
 
 		 501 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.193565  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  35.07 
 
 		 525 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  36.38 
 
 		 502 aa  303  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  36.81 
 
 		 522 aa  303  7.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  35 
 
 		 513 aa  303  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  34.53 
 
 		 511 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  35.47 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  35 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  35.34 
 
 		 520 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  34.95 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  36 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  34.93 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  34.01 
 
 		 501 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 507 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  33.4 
 
 		 514 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  34.14 
 
 		 494 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  34.61 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  33.4 
 
 		 514 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0807  ABC transporter related  34.62 
 
 		 497 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  33.54 
 
 		 501 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  33.67 
 
 		 516 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  34.14 
 
 		 506 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  36.09 
 
 		 506 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  34.99 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  33.4 
 
 		 514 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  35.86 
 
 		 507 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  36.29 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  35.15 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  34.76 
 
 		 525 aa  300  4e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  33.67 
 
 		 516 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  33.94 
 
 		 501 aa  300  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  36.61 
 
 		 517 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  35.23 
 
 		 511 aa  299  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  35.47 
 
 		 495 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  35.86 
 
 		 507 aa  299  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  33.67 
 
 		 516 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  36.61 
 
 		 517 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  36.61 
 
 		 517 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 		 525 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>