More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0695 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  72.32 
 
 		 288 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  71.97 
 
 		 288 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  57.56 
 
 		 293 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  57.56 
 
 		 293 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  50.51 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  43.39 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  38.91 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  38.91 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  38.91 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  38.91 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  38.91 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  37.97 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  37.67 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  33.8 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  32.77 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  32.04 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  28.93 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  29.63 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0999  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  28.37 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  26.81 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  26.96 
 
 		 319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.12 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  28.11 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  27.14 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  29.54 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.88 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  26.95 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  25.45 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  26.04 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  29.58 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  28.47 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0992  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.673974  hitchhiker  0.00851435 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  25.7 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  28.94 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  28.88 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  25.55 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  26.96 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  24.91 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  25.76 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  26.06 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  24.56 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 		 341 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  26.81 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>