75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0683 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0683  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000861523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3593  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3295  hypothetical protein  51.19 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00388648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3292  hypothetical protein  51.19 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00367172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3397  hypothetical protein  51.19 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000126267  normal  0.501015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3218  hypothetical protein  51.19 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000450818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3230  hypothetical protein  51.19 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0859  hypothetical protein  46.43 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3826  hypothetical protein  46.43 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0862  hypothetical protein  46.43 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000942721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3474  hypothetical protein  50.59 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3330  hypothetical protein  50.6 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000429814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0783  yecA family protein  50.6 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000863734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3043  hypothetical protein  50.6 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000773982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0800  hypothetical protein  50.6 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000300982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3328  hypothetical protein  48.81 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3920  hypothetical protein  48.81 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000119576  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02741  hypothetical protein  50.6 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000279044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3068  hypothetical protein  50.6 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000388648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3237  hypothetical protein  50.6 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000591156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02704  hypothetical protein  50.6 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000286708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4202  hypothetical protein  50.6 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0542  hypothetical protein  49.41 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0445  hypothetical protein  48.82 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0282827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2053  hypothetical protein  39.34 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002483  hypothetical protein  36.41 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000288403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03551  hypothetical protein  37.3 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3973  yecA family protein  36.32 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3067  yecA family protein  35.98 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000104077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0605  yecA family protein  34.46 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3306  yecA family protein  37.42 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3678  YecA family protein  34.86 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3154  yecA family protein  35.84 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0830  YgfB and YecA  35.39 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3334  yecA family protein  39.88 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000512216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0619  yecA family protein  39.88 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000645729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2539  hypothetical protein  35.76 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3504  yecA family protein  38.04 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000256627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0614  yecA family protein  37.08 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0814334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3680  yecA family protein  37.08 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3804  yecA family protein  37.08 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0117458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3622  yecA family protein  37.08 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.141978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3214  yecA family protein  36.81 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00848  yecA family protein  32 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0776  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  84.3  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2724  YgfB and YecA  35.19 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1270  hypothetical protein  32.77 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3503  yecA family protein  30.34 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0965  hypothetical protein  33.72 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69010  hypothetical protein  28.81 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1184  yecA family protein  28.65 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2541  yecA family protein  30 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.0500855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5968  hypothetical protein  28.81 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0847  hypothetical protein  32.95 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.110805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1822  protein of unknown function UPF0149  29.94 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0327059  hitchhiker  0.0000000200071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2771  hypothetical protein  31.03 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0184151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0078  hypothetical protein  28.12 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0090  hypothetical protein  28.12 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5435  hypothetical protein  30.46 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1560  YgfB and YecA  30.07 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.272578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02379  hypothetical protein  36.48 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47340  hypothetical protein  27.89 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5224  hypothetical protein  29.21 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2051  hypothetical protein  27.1 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.399878 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1769  hypothetical protein  27.1 
 
 		 217 aa  52  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.187943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0320  hypothetical protein  28.49 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5261  hypothetical protein  28.32 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5108  hypothetical protein  28.41 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.217785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5201  hypothetical protein  28.41 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1878  hypothetical protein  27.81 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.781964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3428  hypothetical protein  32.69 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5026  hypothetical protein  27.59 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0324  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2578  hypothetical protein  27.49 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.737832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>