More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0671 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
374 aa  775    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.81 
 
 
373 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.81 
 
 
373 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.81 
 
 
373 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.72 
 
 
373 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  58.54 
 
 
373 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.27 
 
 
373 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
373 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.64 
 
 
373 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.91 
 
 
373 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  55.59 
 
 
375 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.31 
 
 
375 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.99 
 
 
373 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.81 
 
 
372 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.59 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.04 
 
 
377 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.72 
 
 
379 aa  434  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  53.78 
 
 
384 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.77 
 
 
375 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.16 
 
 
379 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.16 
 
 
379 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.62 
 
 
383 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.89 
 
 
384 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.62 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.62 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.62 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.35 
 
 
383 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.08 
 
 
379 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50.81 
 
 
379 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50.81 
 
 
379 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.08 
 
 
379 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.47 
 
 
384 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.16 
 
 
383 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  47.17 
 
 
375 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.32 
 
 
381 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.26 
 
 
384 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  39.93 
 
 
706 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 
371 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  32.33 
 
 
283 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  33.85 
 
 
288 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 
274 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 
274 aa  156  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 
242 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  27.7 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  27.45 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  30.51 
 
 
447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  29.47 
 
 
439 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 
439 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  29.12 
 
 
443 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 
437 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
258 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 
259 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  24.01 
 
 
375 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  24.1 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  25.27 
 
 
294 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 
292 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  24.62 
 
 
263 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  22.71 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  27.55 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  24.3 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  27.69 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  26.16 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  30.28 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  25.45 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  25.71 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  26.79 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  20.89 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  27.35 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 
237 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
258 aa  63.2  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  24.07 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
258 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  25.11 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  20.59 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  24.31 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  25.47 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  24.31 
 
 
294 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  32.41 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  26.75 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  40.26 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  27.15 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  27.15 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>