More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0623 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0623  fatty acid metabolism regulator  100 
 
 		 239 aa  499  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000168386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2003  fatty acid metabolism regulator  47.66 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000120819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1983  fatty acid metabolism regulator  47.23 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199399  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1999  fatty acid metabolism regulator  48.09 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00814717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2363  fatty acid metabolism regulator  48.09 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000339682  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2109  fatty acid metabolism regulator  48.09 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01162  fatty acid metabolism regulator  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000799515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2461  fatty acid metabolism transcriptional regulator FadR  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000004944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1290  fatty acid metabolism regulator  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1674  fatty acid metabolism regulator  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2438  fatty acid metabolism regulator  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1962  fatty acid metabolism regulator  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000133841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01172  hypothetical protein  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000480756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1345  fatty acid metabolism regulator  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1332  fatty acid metabolism regulator  48.29 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305633  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1943  fatty acid metabolism regulator  47.86 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0247778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2003  fatty acid metabolism regulator  47.86 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1513  fatty acid metabolism regulator  47.86 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1947  fatty acid metabolism regulator  47.86 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0438592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1328  fatty acid metabolism regulator  47.86 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2748  fatty acid metabolism regulator  46.81 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  decreased coverage  0.0000363622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1948  fatty acid metabolism regulator  46.38 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00527579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2244  fatty acid metabolism regulator  46.38 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0118438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2365  fatty acid metabolism regulator  47.01 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000203201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2438  fatty acid metabolism regulator  46.41 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1635  fatty acid metabolism regulator  45.15 
 
 		 241 aa  231  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000615714  normal  0.0628183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2885  fatty acid metabolism regulator  45.15 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2794  fatty acid metabolism regulator  46.81 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00556903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1771  fatty acid metabolism regulator  45.15 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000343571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1815  fatty acid metabolism regulator  45.15 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2507  fatty acid metabolism regulator  45.15 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1778  fatty acid metabolism regulator  45.53 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000719025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1568  fatty acid metabolism regulator  44.73 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1635  fatty acid metabolism regulator  44.07 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000115144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2174  fatty acid metabolism regulator  45.22 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  0.0239474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1924  fatty acid metabolism regulator  43.64 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000876108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2689  fatty acid metabolism regulator  45.98 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449481  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1683  fatty acid metabolism regulator  43.46 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1643  fatty acid metabolism regulator  44.3 
 
 		 241 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000083399  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1743  fatty acid metabolism regulator  42.8 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01148  fatty acid metabolism regulator  44.68 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0433911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2512  fatty acid metabolism regulator  44.4 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal  0.579868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3488  fatty acid metabolism regulator  43.22 
 
 		 237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00186982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02929  fatty acid metabolism regulator  40.79 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002979  transcriptional regulator for fatty acid degradation FadR GntR family  40.07 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1490  fatty acid metabolism regulator  39.71 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2147  fatty acid metabolism regulator  37.72 
 
 		 280 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1661  fatty acid metabolism regulator  38.3 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0855025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0357  regulatory protein GntR HTH  36.44 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2617  regulatory protein GntR HTH  35.02 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5646  regulatory protein GntR HTH  30.99 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2130  regulatory protein GntR HTH  25.59 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0857174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2087  fatty acid responsive transcription factor FadR domain protein  25.12 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30946e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  28.1 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  25.11 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  29.45 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  23.74 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  36.54 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0011  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0277  regulatory protein GntR HTH  34.02 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  20.91 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.04 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  41.54 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  48.28 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  48.28 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  48.28 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  48.28 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  41.38 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  48.28 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  21.92 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  42.59 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  32.35 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  25 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  23.39 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  21.95 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.5 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  22.67 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  45.45 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  24.78 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  24.74 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.5 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.5 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0471  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.915136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  26.58 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  44.44 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>