81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0572 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  100 
 
 		 147 aa  291  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  35.21 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  29.29 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  31.91 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  28.86 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  35.97 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  39.13 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  34.56 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  30.37 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  33.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  37.68 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  35.46 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  34.56 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  31.21 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  38.69 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  38.69 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  32.43 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  38.69 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  32.35 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  31.54 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  30.5 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  28.15 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  32.2 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  31.11 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  33.05 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  30.99 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  32.2 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  32.2 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  32.2 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  32.2 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  32.2 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  32.2 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  32.2 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  31.16 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  28.08 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  30.88 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  29.6 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  31.09 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  32.62 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  26.71 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  28.78 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  30.28 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  30.94 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  27.08 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  25.34 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  28.47 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  25.71 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  35.48 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  35.48 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  32.39 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  30.51 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  30.51 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  30.51 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  30.51 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  22.92 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  28.91 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  24.03 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  25.68 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  34.62 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  34.62 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  23.61 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  29.6 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.17 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  36.73 
 
 		 153 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  26.39 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  27.5 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  32.05 
 
 		 152 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0083  hypothetical protein  28.26 
 
 		 145 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0908948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  23.49 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>