109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0541 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  61.01 
 
 		 223 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  59.31 
 
 		 221 aa  265  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  57.08 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  59.09 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  59.09 
 
 		 245 aa  261  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  57.94 
 
 		 219 aa  261  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  58.64 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  54.95 
 
 		 219 aa  255  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  57.78 
 
 		 222 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  57.78 
 
 		 222 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  57.78 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  56.16 
 
 		 219 aa  254  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  56.54 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  57.01 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  56 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  56.82 
 
 		 221 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  56.82 
 
 		 221 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  55.14 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  55.3 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  58.72 
 
 		 223 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  56.36 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  56.36 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  56.36 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  56.36 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  56.36 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  56.36 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  57.34 
 
 		 221 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  57.34 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  56.36 
 
 		 221 aa  248  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  57.34 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  57.34 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  56.88 
 
 		 221 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  56.88 
 
 		 221 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  54.87 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  56.42 
 
 		 221 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  55.96 
 
 		 221 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  53.74 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  53.74 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  53.74 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  53.74 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  55.87 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  52.51 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  54.19 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  54.19 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  54.19 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  53.69 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  53.69 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  56.65 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  53.74 
 
 		 217 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  52.27 
 
 		 222 aa  224  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  52.27 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  44.19 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  45.73 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  32.51 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  32.46 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  32.83 
 
 		 181 aa  95.5  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  33.65 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  32.74 
 
 		 210 aa  95.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  36.07 
 
 		 210 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  32.23 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  32.23 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  31.58 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  33.49 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  33.63 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  31.38 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  85.1  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  37.87 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  31.65 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  38.3 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  37.87 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  37.87 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  28.11 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  29.45 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  25.99 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  28.94 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  32.05 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  27.93 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  30.13 
 
 		 185 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  32.35 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  31.55 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  29.17 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  24.86 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  29.19 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  28.85 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  28.12 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  30.06 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  25.25 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  28.24 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  24.85 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  25.26 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  28.1 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  25.64 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  24.31 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  24.29 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  29.66 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  26.83 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>