51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0452 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  46.19 
 
 
235 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  45.74 
 
 
235 aa  222  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  45.74 
 
 
235 aa  222  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  42.08 
 
 
253 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  42.06 
 
 
248 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  32.16 
 
 
222 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  31.65 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  27.78 
 
 
575 aa  59.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  29.76 
 
 
385 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  28.12 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  31.34 
 
 
363 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 
440 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  29.59 
 
 
316 aa  53.9  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2959  hypothetical protein  26.35 
 
 
450 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.775689  normal  0.565326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  25.6 
 
 
290 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 
255 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  25.77 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  32 
 
 
510 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  30.37 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  28.87 
 
 
334 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  25.66 
 
 
243 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  25.56 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  28.46 
 
 
315 aa  46.2  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  28.1 
 
 
283 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  25.43 
 
 
266 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  23.35 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  27.42 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  27.42 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0988  OmpA/MotB domain-containing protein  22.46 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  26.62 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  25.81 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  27.42 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  27.42 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  27.42 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  26.29 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  23.77 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  23.77 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  27.42 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  29.27 
 
 
454 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  26.02 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  28.93 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  23.03 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  31.29 
 
 
366 aa  42.4  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  26.57 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.68 
 
 
510 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  29.81 
 
 
317 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  30.23 
 
 
1755 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  29.69 
 
 
1793 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  28.24 
 
 
225 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  29.81 
 
 
317 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>