82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0435 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  100 
 
 
212 aa  446  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  54.21 
 
 
446 aa  234  6e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  53.99 
 
 
446 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  45.83 
 
 
474 aa  188  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  42.37 
 
 
471 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  42.44 
 
 
478 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  38.05 
 
 
463 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  37.18 
 
 
731 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  34.22 
 
 
490 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  35.09 
 
 
482 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  33.19 
 
 
473 aa  114  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  32.91 
 
 
440 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  33.61 
 
 
435 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  29.52 
 
 
464 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 
415 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 
452 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  29.49 
 
 
408 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  31.65 
 
 
429 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  33.76 
 
 
445 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  29.41 
 
 
446 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  32.07 
 
 
429 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  32.05 
 
 
431 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  30.34 
 
 
492 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  31.97 
 
 
435 aa  99.4  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  30.58 
 
 
441 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  30 
 
 
515 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  30.17 
 
 
500 aa  95.9  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  31.73 
 
 
464 aa  94.7  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  31.28 
 
 
627 aa  94.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  29.6 
 
 
532 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  32.1 
 
 
473 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  30.97 
 
 
471 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  32.13 
 
 
538 aa  92.4  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  32.57 
 
 
674 aa  91.3  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  32.09 
 
 
478 aa  90.1  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  27.85 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  28.11 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 
596 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  27.63 
 
 
798 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  29.67 
 
 
473 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  30.4 
 
 
581 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  29.06 
 
 
495 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  27.35 
 
 
466 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  27.13 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  26.38 
 
 
494 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  26.32 
 
 
483 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  27.62 
 
 
606 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  27.4 
 
 
450 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  26.77 
 
 
537 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  29.39 
 
 
711 aa  79  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  27.7 
 
 
584 aa  79  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  27.64 
 
 
505 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  30.56 
 
 
447 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  27.63 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  25.4 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  27.8 
 
 
663 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  28.4 
 
 
479 aa  71.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  26.56 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  23.63 
 
 
474 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  25.98 
 
 
516 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  26.72 
 
 
463 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.91 
 
 
487 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  35.04 
 
 
644 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  24.91 
 
 
486 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.21 
 
 
698 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  22.5 
 
 
555 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.41 
 
 
467 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  33.02 
 
 
410 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.64 
 
 
688 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  33.33 
 
 
581 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  33 
 
 
709 aa  52.4  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 
638 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  32.65 
 
 
690 aa  52  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  42.86 
 
 
434 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.82 
 
 
687 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  24.89 
 
 
460 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  24.89 
 
 
460 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  44.44 
 
 
470 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  41.82 
 
 
704 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  41.07 
 
 
606 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.29 
 
 
704 aa  42.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  26.55 
 
 
715 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>