More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0424 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0424  phage integrase  100 
 
 
374 aa  780  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  51.3 
 
 
356 aa  388  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  50 
 
 
357 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  48 
 
 
357 aa  364  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.53 
 
 
370 aa  118  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  27.35 
 
 
384 aa  116  8e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.68 
 
 
413 aa  113  4e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.38 
 
 
376 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.27 
 
 
376 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.27 
 
 
376 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.2 
 
 
435 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.23 
 
 
376 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.18 
 
 
374 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.18 
 
 
374 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.24 
 
 
387 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.06 
 
 
390 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  30.67 
 
 
383 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.99 
 
 
389 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.47 
 
 
325 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25.27 
 
 
407 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  29.15 
 
 
381 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  29.15 
 
 
381 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.49 
 
 
463 aa  99.8  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.86 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.97 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.55 
 
 
369 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.43 
 
 
368 aa  96.3  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.1 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.44 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  25.16 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.14 
 
 
362 aa  93.6  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  24.49 
 
 
368 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.15 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  25.55 
 
 
396 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  25.49 
 
 
404 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  25.55 
 
 
348 aa  89.7  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  23.67 
 
 
477 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.34 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  25.93 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.08 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  24.13 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  26.55 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.42 
 
 
378 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  25.2 
 
 
349 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  25.2 
 
 
349 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.78 
 
 
385 aa  85.1  2e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  23.15 
 
 
387 aa  85.1  2e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.86 
 
 
373 aa  85.5  2e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  23.78 
 
 
377 aa  84.3  3e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.5 
 
 
371 aa  84.7  3e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25 
 
 
368 aa  83.2  6e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.32 
 
 
378 aa  83.2  7e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  23.13 
 
 
394 aa  81.3  2e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  22.94 
 
 
388 aa  82  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.01 
 
 
391 aa  81.6  2e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.73 
 
 
409 aa  81.3  3e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  25.27 
 
 
388 aa  80.1  6e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  22.19 
 
 
375 aa  79.3  9e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.14455e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  23.12 
 
 
374 aa  79.3  9e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.86 
 
 
393 aa  79  1e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  24 
 
 
373 aa  79  1e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  24.61 
 
 
397 aa  78.2  2e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.02 
 
 
402 aa  78.2  2e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  28 
 
 
471 aa  77.8  3e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  24.1 
 
 
399 aa  77.8  3e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  28 
 
 
471 aa  77.8  3e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.81 
 
 
357 aa  77  4e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  22.04 
 
 
387 aa  77  4e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.15 
 
 
423 aa  77  5e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.8 
 
 
400 aa  76.3  7e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  22.15 
 
 
385 aa  75.9  1e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.36 
 
 
363 aa  75.9  1e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.51 
 
 
391 aa  75.9  1e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25 
 
 
367 aa  74.7  2e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  26 
 
 
506 aa  75.1  2e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.87 
 
 
431 aa  75.1  2e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.55 
 
 
377 aa  75.1  2e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  25.81 
 
 
453 aa  75.1  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.43052e-07  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.24 
 
 
386 aa  74.7  3e-12  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.77 
 
 
392 aa  74.3  3e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  25.47 
 
 
399 aa  74.7  3e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  30.32 
 
 
312 aa  74.3  4e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  24.34 
 
 
402 aa  73.6  6e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  34.73 
 
 
308 aa  73.2  7e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  26.42 
 
 
376 aa  73.2  8e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  7.21683e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  24.2 
 
 
379 aa  72.8  1e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.42 
 
 
414 aa  72.4  1e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  34.34 
 
 
209 aa  72  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  26.24 
 
 
376 aa  70.9  3e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.13824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.71 
 
 
385 aa  71.2  3e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  25.45 
 
 
422 aa  70.5  4e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  24.74 
 
 
354 aa  70.5  4e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  24.74 
 
 
354 aa  70.5  4e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25.14 
 
 
404 aa  70.1  6e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.97 
 
 
391 aa  70.1  6e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  22.77 
 
 
424 aa  69.7  9e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.05 
 
 
422 aa  68.9  1e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  22.76 
 
 
442 aa  69.3  1e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  20.76 
 
 
380 aa  68.2  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.417277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>