233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0376 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  100 
 
 
439 aa  877    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  54.4 
 
 
441 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  52.86 
 
 
455 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  48.49 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  47.1 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  47.56 
 
 
453 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  46.87 
 
 
454 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  47.8 
 
 
453 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  47.33 
 
 
454 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  46.64 
 
 
453 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  47.33 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  47.33 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  47.83 
 
 
454 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  47.1 
 
 
453 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  45.08 
 
 
447 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  44.83 
 
 
447 aa  362  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  45.06 
 
 
447 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  44.85 
 
 
447 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  44.85 
 
 
447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  44.85 
 
 
447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  44.39 
 
 
447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  44.37 
 
 
447 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  44.39 
 
 
447 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  44.39 
 
 
447 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  44.39 
 
 
447 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1488  K+ transporter Trk  45.48 
 
 
453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  40.72 
 
 
449 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  42.79 
 
 
445 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  43.02 
 
 
446 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  45 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  44.7 
 
 
439 aa  309  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  44.7 
 
 
439 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  44.92 
 
 
439 aa  309  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  44.7 
 
 
439 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  43.4 
 
 
446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  44.7 
 
 
439 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  44.7 
 
 
439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  44.24 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  44.47 
 
 
439 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  44.7 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  42.86 
 
 
446 aa  299  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  45.13 
 
 
420 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  43.57 
 
 
447 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  40.32 
 
 
443 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  41.76 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  42.27 
 
 
471 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  41.42 
 
 
443 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  40.36 
 
 
455 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  42.82 
 
 
454 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.74 
 
 
456 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  41.31 
 
 
455 aa  278  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  40.09 
 
 
444 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  38.8 
 
 
441 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  39.21 
 
 
443 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  39.67 
 
 
458 aa  263  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  38.24 
 
 
457 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  39.32 
 
 
446 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  39.22 
 
 
443 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  36.99 
 
 
447 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  37.81 
 
 
451 aa  256  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  38.99 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  38.86 
 
 
446 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  39.82 
 
 
454 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  39.82 
 
 
454 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  40.6 
 
 
447 aa  251  2e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.95 
 
 
435 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.95 
 
 
435 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.67 
 
 
442 aa  249  6e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1475  TrkH family potassium uptake protein  38.44 
 
 
447 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  36.49 
 
 
422 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  37.75 
 
 
457 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  39.44 
 
 
456 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  38.53 
 
 
453 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.93 
 
 
430 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.84 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0138  TRK system potassium uptake protein TrkB, putative  38.1 
 
 
447 aa  244  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  37.99 
 
 
431 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1300  TrkH family potassium uptake protein  37.99 
 
 
447 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  38.99 
 
 
443 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0441  TrkH family potassium uptake protein  37.76 
 
 
447 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  36.26 
 
 
447 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  36.11 
 
 
442 aa  236  7e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.73 
 
 
449 aa  236  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.61 
 
 
447 aa  236  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  36.43 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  35.67 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.62 
 
 
452 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  35.35 
 
 
586 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.64 
 
 
446 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.12 
 
 
454 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.09 
 
 
453 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.58 
 
 
633 aa  230  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  37.35 
 
 
443 aa  229  6e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  35.12 
 
 
586 aa  229  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  38.63 
 
 
574 aa  229  7e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  36.57 
 
 
469 aa  229  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.33 
 
 
455 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  37.03 
 
 
443 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.77 
 
 
616 aa  226  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  36.2 
 
 
467 aa  226  8e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>