More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0346 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
154 aa  316  7.999999999999999e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  68.83 
 
 
157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  68.83 
 
 
157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  68.83 
 
 
157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  68.83 
 
 
157 aa  223  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  68.83 
 
 
157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  69.48 
 
 
161 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  68.18 
 
 
159 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  71.14 
 
 
154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  68.83 
 
 
157 aa  217  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  67.53 
 
 
161 aa  216  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  68.46 
 
 
154 aa  214  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  66.88 
 
 
159 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  66.88 
 
 
157 aa  213  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  68.46 
 
 
154 aa  213  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  70.78 
 
 
155 aa  208  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  70.78 
 
 
155 aa  208  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  70.78 
 
 
155 aa  207  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  70.78 
 
 
155 aa  207  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  70.78 
 
 
155 aa  207  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  70.78 
 
 
155 aa  207  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  70.78 
 
 
155 aa  207  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  70.13 
 
 
155 aa  206  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  70.13 
 
 
155 aa  206  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  70.13 
 
 
155 aa  206  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  64.83 
 
 
158 aa  199  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  68.18 
 
 
157 aa  199  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  65.52 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  64.14 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  60.39 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3007  putative metalloprotease  68.18 
 
 
157 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  64.14 
 
 
156 aa  191  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  67.11 
 
 
153 aa  190  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  63.45 
 
 
157 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  60.4 
 
 
152 aa  183  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  60.69 
 
 
153 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  66.89 
 
 
153 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  66.89 
 
 
153 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  66.89 
 
 
153 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  60 
 
 
157 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  66.22 
 
 
153 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  61.49 
 
 
149 aa  176  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  66.9 
 
 
153 aa  174  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  52.67 
 
 
155 aa  174  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  65.54 
 
 
153 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  65.54 
 
 
153 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  54.97 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  69.92 
 
 
153 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  69.92 
 
 
153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  57.05 
 
 
168 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  56.85 
 
 
162 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  57.05 
 
 
160 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  53.21 
 
 
158 aa  165  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  59.86 
 
 
153 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  54.9 
 
 
158 aa  163  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  53.9 
 
 
160 aa  159  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  54.05 
 
 
154 aa  156  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  52.78 
 
 
149 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  58.22 
 
 
164 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  58.22 
 
 
157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  49.65 
 
 
161 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  51.01 
 
 
154 aa  147  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  55.48 
 
 
150 aa  147  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  54.11 
 
 
166 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  52.94 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  54.79 
 
 
166 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  56.85 
 
 
157 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  56.16 
 
 
157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  56.16 
 
 
151 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  47.18 
 
 
161 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  47.18 
 
 
161 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  53.17 
 
 
153 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  51.75 
 
 
166 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.24 
 
 
245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  61.6 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  47.68 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  47.68 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.13 
 
 
270 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.13 
 
 
270 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  48.39 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.13 
 
 
255 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  48.53 
 
 
149 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.69 
 
 
237 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  46 
 
 
152 aa  130  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  46 
 
 
152 aa  130  9e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  49.31 
 
 
258 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  45.81 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.92 
 
 
258 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.92 
 
 
258 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.92 
 
 
258 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  42.5 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 
261 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  54.31 
 
 
261 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.41 
 
 
274 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  44.94 
 
 
167 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  46.04 
 
 
171 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  54.87 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  48.61 
 
 
147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.818289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>