285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0316 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0316  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 218 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.152256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  63.94 
 
 		 227 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  61.21 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  60.09 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  61.21 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  61.21 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  61.21 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  61.21 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  61.21 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  61.21 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  61.21 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  59.63 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  59.63 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  60.75 
 
 		 213 aa  274  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  61.03 
 
 		 235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  63.94 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  59.17 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  61.97 
 
 		 218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  58.72 
 
 		 219 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  63.33 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  59.63 
 
 		 217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  59.63 
 
 		 217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  59.63 
 
 		 217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  59.63 
 
 		 217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  61.72 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  61.54 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  67.02 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  58.72 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  62.69 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  62.69 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  62.69 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  62.69 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  58.26 
 
 		 216 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  56.42 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  62.19 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  57.21 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  61.84 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  58.9 
 
 		 217 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 223 aa  259  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  61.35 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  61.14 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  59.07 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  60.87 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  61.66 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  56.19 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  54.3 
 
 		 228 aa  254  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  58.1 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  55.5 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  56.94 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  58.1 
 
 		 220 aa  248  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  54.21 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  54.98 
 
 		 214 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  56.52 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  53.27 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  55.4 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  55.4 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  54.25 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  53.05 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  55.39 
 
 		 220 aa  235  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  59.13 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  53.67 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  54.46 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  52.74 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  52.74 
 
 		 199 aa  232  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  57.46 
 
 		 205 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  57.54 
 
 		 203 aa  227  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  52.34 
 
 		 217 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  52.34 
 
 		 217 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  52.04 
 
 		 215 aa  225  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  52.63 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  51.46 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  50.24 
 
 		 215 aa  208  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  53.07 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  51.35 
 
 		 218 aa  207  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  51.67 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  45.07 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  46.34 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1350  lipoate-protein ligase B  47.85 
 
 		 242 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0666448  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1413  lipoate-protein ligase B  47.85 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000174244  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  51.38 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  51.38 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  51.47 
 
 		 255 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  50.54 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2500  lipoate-protein ligase B  46.73 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  53.12 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  53.09 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  47.62 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0060  lipoate-protein ligase B  54.75 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6231  lipoate-protein ligase B  50.53 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2938  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0416  lipoate-protein ligase B  51.35 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110487  normal  0.120766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  52.36 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  53.3 
 
 		 229 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>