More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0312 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  62.7 
 
 
252 aa  293  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  54.38 
 
 
181 aa  220  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  43.07 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  48.43 
 
 
831 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  45.88 
 
 
232 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.23 
 
 
343 aa  153  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  48.62 
 
 
1493 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  48.78 
 
 
489 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  49.36 
 
 
267 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  58.91 
 
 
256 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  43.68 
 
 
1402 aa  143  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  49.66 
 
 
684 aa  142  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.53 
 
 
318 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  43.9 
 
 
376 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  45.45 
 
 
380 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.05 
 
 
393 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  49.35 
 
 
208 aa  138  7e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  43.29 
 
 
376 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  46.62 
 
 
490 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  45.95 
 
 
490 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  47.4 
 
 
416 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  46.98 
 
 
448 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.14 
 
 
341 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  42.77 
 
 
789 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  41.81 
 
 
305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.56 
 
 
961 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  43.5 
 
 
557 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  45.64 
 
 
185 aa  131  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  42.24 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  43.35 
 
 
2413 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.95 
 
 
241 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  40.22 
 
 
264 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  46.41 
 
 
255 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.92 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  44.94 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  39.66 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.51 
 
 
346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  44.68 
 
 
509 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  41.34 
 
 
425 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  44.68 
 
 
509 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.89 
 
 
373 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  44.68 
 
 
509 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  44.68 
 
 
509 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  47.55 
 
 
1002 aa  122  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  41.52 
 
 
731 aa  122  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.01 
 
 
1037 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.68 
 
 
528 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.89 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.47 
 
 
373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  36.57 
 
 
331 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  36.57 
 
 
331 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  37.5 
 
 
331 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  44.3 
 
 
1877 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  36.57 
 
 
331 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.75 
 
 
838 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 
359 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.8 
 
 
246 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.08 
 
 
685 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  37.93 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.61 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  43.21 
 
 
303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  39.61 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  37.43 
 
 
325 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  48.57 
 
 
380 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.63 
 
 
380 aa  112  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  39.11 
 
 
399 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  37.8 
 
 
523 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  39.2 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  37.89 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 
1032 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  37.27 
 
 
327 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  38.1 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  40.12 
 
 
464 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 
172 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  49.12 
 
 
117 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
1430 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  33.17 
 
 
213 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  40.54 
 
 
763 aa  106  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  38.22 
 
 
365 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.1 
 
 
482 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  42.96 
 
 
1910 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
976 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.85 
 
 
321 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.72 
 
 
392 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.54 
 
 
329 aa  104  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  44.85 
 
 
221 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  45.6 
 
 
294 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.6 
 
 
294 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.69 
 
 
321 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.14 
 
 
211 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.74 
 
 
255 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  41.61 
 
 
552 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  40.54 
 
 
365 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.13 
 
 
316 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  38.06 
 
 
276 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  33.99 
 
 
978 aa  101  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  40.71 
 
 
410 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>