More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0292 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0292  glycosyltransferase  100 
 
 		 348 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000491136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  29.12 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  29.12 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  25.74 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 398 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 374 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  23.57 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.51 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  23.51 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.92 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.59 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.33 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1456  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  27.16 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.9 
 
 		 745 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.82 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.28 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  25.25 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 1080 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.94 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 739 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  32.14 
 
 		 428 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.05 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.05 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  23.71 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.88 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  26.94 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  23.53 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 772 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  23.14 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.33 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  23.22 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.07 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0440  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.438778  normal  0.0102055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  23.29 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  23.78 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  22.08 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  29.53 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>