248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0289 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0289  transport system permease  100 
 
 		 419 aa  813    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  63.7 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  64.94 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  60.09 
 
 		 420 aa  512  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  65.88 
 
 		 419 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  62.91 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  64.47 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  63.15 
 
 		 420 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  63.53 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  66.43 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  64.94 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  64.24 
 
 		 419 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  64.24 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  64 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  64.47 
 
 		 419 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  63.53 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  63.29 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  64.45 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  63.29 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  63.06 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  63.74 
 
 		 423 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  63.74 
 
 		 423 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  60.96 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  61.65 
 
 		 425 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  62.59 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  63.51 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  57.35 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  62.59 
 
 		 425 aa  471  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  63.29 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  56.4 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  56.63 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  56.87 
 
 		 422 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  58.84 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  57.86 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  59.09 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  58 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  59.56 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  54.76 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  58.56 
 
 		 408 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  55 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  55.47 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  52.88 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  53.98 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  54.44 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  52.13 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  53.38 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  53 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  52 
 
 		 424 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  52 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  53.38 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  52.06 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  53.14 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  52 
 
 		 424 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  53.38 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  52 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  51.19 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  51.58 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  51.52 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  52.13 
 
 		 566 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  51.76 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  51.57 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  51.95 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  51.71 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  53.94 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  51.33 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  52.58 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  52.7 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  52.7 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  49.52 
 
 		 406 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  51.33 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  51.22 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  50.24 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  51.67 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  50.98 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  52.62 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  48.72 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  50.24 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  50.24 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  50.98 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  50.24 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  54.42 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  51.44 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  51.67 
 
 		 416 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  49.76 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  49.76 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  51.71 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  51.22 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  51.44 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  51.71 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  51.67 
 
 		 416 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  51.71 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  51.44 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  51.71 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  51.67 
 
 		 416 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  51.71 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  51.71 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  49.28 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  49.28 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  49.13 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  50.89 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>