242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0287 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  47.04 
 
 
750 aa  661    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  100 
 
 
757 aa  1561    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  48.55 
 
 
755 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  48.55 
 
 
755 aa  740    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  47.16 
 
 
754 aa  686    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  40.62 
 
 
778 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  39.95 
 
 
778 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  48.17 
 
 
328 aa  316  9e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1975  Glutathione synthase  33.64 
 
 
462 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0781696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  36.97 
 
 
881 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2049  glutamate-cysteine ligase  30.93 
 
 
484 aa  196  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  36.04 
 
 
876 aa  194  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  34.78 
 
 
896 aa  187  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1557  glutamate--cysteine ligase  34.43 
 
 
474 aa  187  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0061  glutamate-cysteine ligase  28.74 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.398399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3086  glutamate--cysteine ligase  29.61 
 
 
547 aa  184  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0401294  hitchhiker  0.00000000000210379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0847  glutamate--cysteine ligase  30.09 
 
 
520 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000051454  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3087  glutamate--cysteine ligase  29.8 
 
 
537 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00169886  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2536  glutamate--cysteine ligase  29.41 
 
 
533 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3202  glutamate--cysteine ligase  29.8 
 
 
537 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.676712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3149  glutamate--cysteine ligase  29.41 
 
 
533 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3143  glutamate--cysteine ligase  29.8 
 
 
537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000827615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3207  glutamate--cysteine ligase  29.67 
 
 
517 aa  180  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0090  glutamate--cysteine ligase  30.45 
 
 
524 aa  180  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3169  glutamate--cysteine ligase  29.19 
 
 
537 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00288227  hitchhiker  0.00000108947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  33.54 
 
 
894 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1120  glutamate--cysteine ligase  29.45 
 
 
517 aa  178  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00403409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  34.81 
 
 
862 aa  178  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0117  glutamate--cysteine ligase  27.85 
 
 
533 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000417338  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0324  glutamate--cysteine ligase  27.63 
 
 
548 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000109041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2302  glutamate--cysteine ligase  27.85 
 
 
537 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2325  glutamate--cysteine ligase  27.85 
 
 
537 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2251  glutamate--cysteine ligase  27.85 
 
 
537 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0100341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0118  glutamate--cysteine ligase  27.85 
 
 
537 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000414773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2834  glutamate--cysteine ligase  27.85 
 
 
537 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000012706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6505  glutamate--cysteine ligase  29.35 
 
 
537 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104225  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  33.99 
 
 
890 aa  176  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0134  glutamate--cysteine ligase  27.63 
 
 
537 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3369  glutamate--cysteine ligase  28.32 
 
 
532 aa  175  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00208999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0891  glutamate--cysteine ligase  28.32 
 
 
532 aa  175  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000207295  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3953  glutamate--cysteine ligase  29.32 
 
 
538 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124779  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4484  glutamate--cysteine ligase  29.86 
 
 
538 aa  174  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0203665  unclonable  0.00000138966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  34.56 
 
 
894 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3234  glutamate--cysteine ligase  28.32 
 
 
532 aa  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314176  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1002  glutamate--cysteine ligase  29.23 
 
 
518 aa  174  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5948  glutamate--cysteine ligase  31.75 
 
 
527 aa  173  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  31.18 
 
 
856 aa  173  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  32.8 
 
 
872 aa  173  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  31.18 
 
 
856 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0087  glutamate--cysteine ligase  28.02 
 
 
548 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000417414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68730  glutamate--cysteine ligase  32.05 
 
 
527 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0643  glutamate--cysteine ligase  27.06 
 
 
521 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002530  glutamate--cysteine ligase  27.44 
 
 
522 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  32.62 
 
 
861 aa  170  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02543  glutamate-cysteine ligase  29.22 
 
 
518 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0996  glutamate/cysteine ligase  29.22 
 
 
518 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2971  glutamate--cysteine ligase  29.22 
 
 
518 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000810543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02508  hypothetical protein  29.22 
 
 
518 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  33.69 
 
 
865 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1019  glutamate--cysteine ligase  29.22 
 
 
518 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.145998  normal  0.0132259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3637  glutamate/cysteine ligase  29.69 
 
 
518 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1395  glutamate-cysteine ligase  29.67 
 
 
509 aa  169  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3934  glutamate--cysteine ligase  29.22 
 
 
518 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.161519  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3260  glutamate--cysteine ligase  30.38 
 
 
549 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2824  glutamate--cysteine ligase  29.22 
 
 
518 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00050885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3188  glutamate--cysteine ligase  29.22 
 
 
518 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00136573  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  31.75 
 
 
856 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1329  glutamate--cysteine ligase  29.63 
 
 
544 aa  168  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.423999  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  32.51 
 
 
857 aa  168  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1098  glutamate--cysteine ligase  30.17 
 
 
549 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2810  glutamate--cysteine ligase  29 
 
 
518 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000302956  hitchhiker  0.00165416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  33.53 
 
 
882 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1132  glutamate--cysteine ligase  30.17 
 
 
549 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0987  glutamate--cysteine ligase  28.85 
 
 
520 aa  167  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  33.13 
 
 
856 aa  167  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0201  glutamate--cysteine ligase  29.45 
 
 
523 aa  167  5.9999999999999996e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  31.99 
 
 
875 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  34.65 
 
 
908 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1031  glutamate--cysteine ligase  29.96 
 
 
549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3127  glutamate--cysteine ligase  29.09 
 
 
518 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  0.0373745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0268  glutamate--cysteine ligase  31.01 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3003  glutamate--cysteine ligase  29.09 
 
 
518 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179247  hitchhiker  0.000116011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3020  glutamate--cysteine ligase  29.09 
 
 
518 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.427194  hitchhiker  0.0000869019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2937  glutamate--cysteine ligase  29.09 
 
 
518 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  32.81 
 
 
855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2968  glutamate--cysteine ligase  29.09 
 
 
518 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209272  hitchhiker  0.00113196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0243  glutamate--cysteine ligase  30.73 
 
 
525 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2467  glutamate--cysteine ligase  30.2 
 
 
509 aa  165  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  32.93 
 
 
893 aa  165  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  31.68 
 
 
861 aa  165  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0258  glutamate--cysteine ligase  30.73 
 
 
530 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358158  normal  0.0162786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  31.68 
 
 
861 aa  165  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  34.37 
 
 
855 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  37.36 
 
 
858 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3571  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  26.41 
 
 
518 aa  164  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03486  glutamate--cysteine ligase  26.76 
 
 
522 aa  164  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0356  glutamate--cysteine ligase  31.52 
 
 
526 aa  164  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05020  glutamate--cysteine ligase  27.84 
 
 
530 aa  164  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402642  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0325  glutamate--cysteine ligase  31.76 
 
 
529 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1308  glutamate--cysteine ligase  32.66 
 
 
527 aa  163  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>