75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0230 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1187    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  40.2 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  40.2 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  40.2 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  40.2 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  40.2 
 
 
586 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  40.03 
 
 
586 aa  465  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  40.03 
 
 
586 aa  465  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  40.03 
 
 
586 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  40.03 
 
 
586 aa  465  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  40.03 
 
 
586 aa  465  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  40.03 
 
 
586 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  40.03 
 
 
586 aa  465  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  40.03 
 
 
586 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  40.03 
 
 
586 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  39.45 
 
 
598 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  39.45 
 
 
598 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  39.59 
 
 
586 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  39.45 
 
 
598 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  40.03 
 
 
593 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  38.99 
 
 
582 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  39.46 
 
 
582 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  37.21 
 
 
590 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  37.65 
 
 
590 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  37.58 
 
 
602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  36.96 
 
 
602 aa  405  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  37.93 
 
 
600 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  36.29 
 
 
601 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  32.42 
 
 
595 aa  297  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  31.15 
 
 
596 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  30.43 
 
 
596 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.26 
 
 
596 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  30.43 
 
 
596 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  29.78 
 
 
595 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  29.78 
 
 
595 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  30.58 
 
 
592 aa  279  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  29.6 
 
 
595 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  29.6 
 
 
595 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  29.69 
 
 
604 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  31.51 
 
 
594 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  30.73 
 
 
595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  27.23 
 
 
596 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  28.99 
 
 
594 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  28.55 
 
 
595 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  29.43 
 
 
594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  24.96 
 
 
613 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  26.15 
 
 
622 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  25.92 
 
 
607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  24.03 
 
 
607 aa  183  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  25.86 
 
 
609 aa  183  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  24.55 
 
 
615 aa  170  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  24.7 
 
 
617 aa  170  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  24.7 
 
 
617 aa  170  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  26.45 
 
 
600 aa  154  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  24.83 
 
 
637 aa  153  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  25.23 
 
 
509 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  24.62 
 
 
637 aa  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  28.46 
 
 
586 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  24.49 
 
 
611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  25.1 
 
 
625 aa  133  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  29.27 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  23.28 
 
 
624 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  25.5 
 
 
641 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  21.71 
 
 
647 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  22.03 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  26.28 
 
 
642 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  22.91 
 
 
635 aa  104  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.73 
 
 
638 aa  104  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  21.4 
 
 
614 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  21.26 
 
 
621 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  21.26 
 
 
621 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  21.19 
 
 
621 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  20.47 
 
 
630 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  22.71 
 
 
597 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  34.02 
 
 
458 aa  44.3  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>