More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0185 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  48.45 
 
 		 171 aa  171  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  54.09 
 
 		 182 aa  170  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  48.47 
 
 		 169 aa  170  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  48.47 
 
 		 169 aa  170  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  48.47 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 168 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  47.93 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 		 170 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  47.34 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  47.34 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  47.34 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  47.53 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  46.25 
 
 		 164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  46.25 
 
 		 164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  49.06 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  48.12 
 
 		 169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  47.85 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  43.29 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  44.17 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  43.98 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  46.39 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  46.06 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  43.37 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  42.17 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  48.61 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  42.86 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  43.83 
 
 		 173 aa  143  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  41.83 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  46.05 
 
 		 359 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 359 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 358 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  45.21 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  45.07 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40.25 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 357 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  43.04 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  40.62 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.52 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  39.63 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  44.78 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  43.08 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.35 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>