More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0177 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 333 aa  695    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  80.12 
 
 		 334 aa  577  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.88 
 
 		 334 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  80.06 
 
 		 334 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.61 
 
 		 334 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.46 
 
 		 334 aa  564  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.46 
 
 		 334 aa  564  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.46 
 
 		 334 aa  564  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  79.46 
 
 		 334 aa  564  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.46 
 
 		 334 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.46 
 
 		 334 aa  564  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.15 
 
 		 334 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.15 
 
 		 334 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.34 
 
 		 334 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.92 
 
 		 334 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.15 
 
 		 334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.92 
 
 		 334 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.25 
 
 		 334 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.92 
 
 		 334 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.92 
 
 		 334 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.92 
 
 		 334 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.06 
 
 		 346 aa  544  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.06 
 
 		 346 aa  544  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.06 
 
 		 346 aa  544  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.51 
 
 		 332 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 		 332 aa  518  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 		 332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  71 
 
 		 332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 		 332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 		 332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 		 332 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.49 
 
 		 332 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.3 
 
 		 332 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  71 
 
 		 332 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  71 
 
 		 332 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  71 
 
 		 332 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  71 
 
 		 332 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.21 
 
 		 335 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.91 
 
 		 335 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0246  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.09 
 
 		 336 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.09 
 
 		 338 aa  484  1e-135  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 337 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 		 365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 336 aa  447  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 333 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 345 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 334 aa  418  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 327 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 351 aa  359  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 342 aa  358  8e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 329 aa  355  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 329 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0575  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.415055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  352  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0949  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 332 aa  349  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 341 aa  348  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 344 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0984  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 357 aa  341  9e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 340 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4204  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 345 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0815  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 341 aa  332  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1014  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00140566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>