More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0160 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
158 aa  327  3e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  47.62 
 
 
106 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  45.63 
 
 
106 aa  104  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  45.63 
 
 
106 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  48.11 
 
 
107 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  45.79 
 
 
108 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  45.79 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  45.79 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  45.79 
 
 
108 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  45.79 
 
 
108 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  45.79 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  45.79 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  45.79 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  46.23 
 
 
106 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  45.79 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  44.9 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  42 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  42 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  46.94 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  42 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  44.79 
 
 
108 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  42.31 
 
 
110 aa  94.4  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  42 
 
 
101 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  43.75 
 
 
108 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  43.75 
 
 
108 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  43.75 
 
 
108 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  41 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  43.75 
 
 
108 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  42.42 
 
 
109 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  42.42 
 
 
109 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  42.42 
 
 
109 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  41 
 
 
108 aa  91.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  39 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  43.75 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  41.35 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  41.9 
 
 
110 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  41.9 
 
 
110 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  41.9 
 
 
110 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  43.81 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  42.42 
 
 
107 aa  87  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
102 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  42.71 
 
 
106 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  40.95 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  39.22 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  41.67 
 
 
100 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  43.04 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  41.67 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  36.63 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  38.3 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  37.23 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  30.13 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  32.26 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  29.84 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  38 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  32.08 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  31 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  28.97 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  31 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  31.9 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  27.05 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  38.16 
 
 
110 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  30.39 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  30.39 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  27.5 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  27.42 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 
656 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  26.17 
 
 
141 aa  61.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  28.37 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  27.45 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  31.43 
 
 
135 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
260 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  30.33 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>