259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0123 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002480  ribose 5-phosphate isomerase A  68.49 
 
 		 218 aa  294  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00368346  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2056  ribose-5-phosphate isomerase A  68.04 
 
 		 218 aa  292  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000849677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  65.75 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  67.12 
 
 		 218 aa  288  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  65.3 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1092  ribose-5-phosphate isomerase A  66.67 
 
 		 219 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.981456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  64.38 
 
 		 239 aa  284  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  65.28 
 
 		 220 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  65.28 
 
 		 220 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  65.28 
 
 		 220 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  64.68 
 
 		 219 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  65.28 
 
 		 220 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  63.93 
 
 		 218 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0974  ribose-5-phosphate isomerase A  65.28 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1012  ribose-5-phosphate isomerase A  65.28 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0978  ribose-5-phosphate isomerase A  65.28 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  64.81 
 
 		 219 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0816  ribose-5-phosphate isomerase A  65.14 
 
 		 219 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3508  ribose-5-phosphate isomerase A  63.47 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846939  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  64.38 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3877  ribose-5-phosphate isomerase A  63.3 
 
 		 238 aa  278  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2542  ribose-5-phosphate isomerase A  65.74 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  64.35 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  63.3 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0858  ribose-5-phosphate isomerase A  62.84 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3822  ribose-5-phosphate isomerase A  62.84 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0855  ribose-5-phosphate isomerase A  62.84 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000367757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  60.73 
 
 		 220 aa  271  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  62.39 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1545  ribose-5-phosphate isomerase A  61.19 
 
 		 218 aa  268  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  59.17 
 
 		 218 aa  267  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03207  ribose-5-phosphate isomerase A  63.43 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.335569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  58.45 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2736  ribose-5-phosphate isomerase A  65.14 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0315  ribose-5-phosphate isomerase A  59.09 
 
 		 224 aa  257  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  57.8 
 
 		 220 aa  255  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5150  ribose-5-phosphate isomerase A  58.64 
 
 		 224 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5057  ribose-5-phosphate isomerase A  58.64 
 
 		 224 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0548  ribose 5-phosphate isomerase  58.8 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.231532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5382  ribose-5-phosphate isomerase A  56.95 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48280  Ribose 5-phosphate isomerase  58.3 
 
 		 226 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5203  ribose-5-phosphate isomerase A  58.18 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0147  ribose-5-phosphate isomerase A  58.06 
 
 		 220 aa  251  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000234877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2178  ribose-5-phosphate isomerase A  58.06 
 
 		 220 aa  251  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000360334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4847  ribose-5-phosphate isomerase A  56.76 
 
 		 223 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5289  ribose 5-phosphate isomerase  56.76 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0695  ribose 5-phosphate isomerase  57.41 
 
 		 220 aa  249  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  58.57 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04310  ribose-5-phosphate isomerase A  56.05 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000120698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0647  ribose-5-phosphate isomerase A  59.52 
 
 		 223 aa  248  5e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.807989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0422  ribose-5-phosphate isomerase A  55.16 
 
 		 223 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1176  ribose-5-phosphate isomerase A  56.67 
 
 		 219 aa  245  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4223  ribose-5-phosphate isomerase A  56.5 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0436  ribose-5-phosphate isomerase A  57.8 
 
 		 219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4136  ribose 5-phosphate isomerase  55.16 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00349227  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  56.94 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2134  ribose-5-phosphate isomerase A  54.79 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1568  ribose-5-phosphate isomerase A  56.82 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1526  ribose-5-phosphate isomerase A  55.25 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3437  ribose-5-phosphate isomerase A  53.6 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22160  Ribose 5-phosphate isomerase  54.09 
 
 		 224 aa  237  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02384  ribose-5-phosphate isomerase A  57.07 
 
 		 215 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0779  ribose-5-phosphate isomerase A  53.92 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0129  ribose-5-phosphate isomerase A  55.56 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  56.42 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1462  ribose-5-phosphate isomerase A  53.92 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1056  ribose-5-phosphate isomerase A  54.34 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0956  ribose-5-phosphate isomerase A  53.92 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3560  ribose-5-phosphate isomerase A  53.36 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0842  ribose-5-phosphate isomerase A  56.31 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0960  ribose-5-phosphate isomerase A  56.31 
 
 		 215 aa  231  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0969642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0019  ribose-5-phosphate isomerase A  55 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2456  ribose-5-phosphate isomerase A  51.58 
 
 		 230 aa  228  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3987  ribose-5-phosphate isomerase A  53.6 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195243  normal  0.0478731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1521  ribose-5-phosphate isomerase A  54.21 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414948  decreased coverage  0.0000820366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3283  ribose-5-phosphate isomerase A  56.1 
 
 		 215 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0717446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2131  ribose-5-phosphate isomerase A  51.8 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1651  ribose-5-phosphate isomerase A  51.8 
 
 		 229 aa  225  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3387  ribose-5-phosphate isomerase A  55 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.568602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0629  ribose 5-phosphate isomerase A  51.87 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0779  ribose 5-phosphate isomerase  51.87 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2156  ribose-5-phosphate isomerase A  51.58 
 
 		 243 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2857  ribose-5-phosphate isomerase A  51.77 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1934  ribose-5-phosphate isomerase A  51.8 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0108  ribose-5-phosphate isomerase A  58.76 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0093  ribose-5-phosphate isomerase A  58.76 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2616  ribose-5-phosphate isomerase A  50.9 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2088  ribose-5-phosphate isomerase A  50.22 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0149  ribose-5-phosphate isomerase A  48.68 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1803  ribose-5-phosphate isomerase A  48.68 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>