11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0086 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0086  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  474  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00135012  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0823  metallophosphoesterase  41.23 
 
 
236 aa  194  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6150  metallophosphoesterase  39.82 
 
 
228 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1718  metallophosphoesterase  40.51 
 
 
226 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0362853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1333  metallophosphoesterase  36.1 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3343  metallophosphoesterase  36.56 
 
 
238 aa  105  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5905  hypothetical protein  40.68 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1332  metallophosphoesterase  30.58 
 
 
287 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992901  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2548  metallophosphoesterase  27.36 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  29.15 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0919  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0649979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>