More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0051 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3650  ABC transporter related  62.82 
 
 		 527 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3521  autoinducer AI-2 ABC transporter, ATP binding protein  62.82 
 
 		 527 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0051  ABC transporter, ATP-binding, sugar transport  100 
 
 		 502 aa  1026    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000186076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0858  autoinducer AI-2 ABC transporter ATP binding protein  62.62 
 
 		 527 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1595  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  62.48 
 
 		 511 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2133  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 511 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0375585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1659  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  62.28 
 
 		 511 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2145  ABC transporter related  62.28 
 
 		 511 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2126  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  61.88 
 
 		 511 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4472  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  60.88 
 
 		 511 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4320  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  60.88 
 
 		 511 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4290  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  60.88 
 
 		 511 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4402  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  60.88 
 
 		 511 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4405  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  60.68 
 
 		 511 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3536  ABC transporter related  59.76 
 
 		 495 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3503  sugar ABC transporter ATPase  43.2 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3149  ABC transporter related  43.2 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180816  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2772  ABC transporter related  39.07 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0913343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2263  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1714  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  60.76 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3017  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3015  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.06 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0481734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2979  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2716  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2975  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 493 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000730474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2696  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2766  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 		 496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2978  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 		 496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  36.96 
 
 		 519 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.25 
 
 		 503 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.27 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.47 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.82 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 501 aa  329  9e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  36.4 
 
 		 513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  38.23 
 
 		 503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  36 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  38.12 
 
 		 499 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  36.6 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  36.38 
 
 		 506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  35.98 
 
 		 512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  36.53 
 
 		 492 aa  320  5e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  37.73 
 
 		 487 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.13 
 
 		 495 aa  320  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.66 
 
 		 508 aa  319  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  38.22 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 		 510 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  36.78 
 
 		 495 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  37.45 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.83 
 
 		 507 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  36.83 
 
 		 507 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  36.83 
 
 		 507 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 494 aa  317  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  37.65 
 
 		 501 aa  317  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  36.8 
 
 		 508 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.1 
 
 		 514 aa  316  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35.8 
 
 		 494 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 494 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 		 515 aa  315  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 494 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  37.2 
 
 		 502 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  37.23 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  37.48 
 
 		 504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  36.93 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  37.35 
 
 		 513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.71 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 		 494 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  37.2 
 
 		 495 aa  313  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  35.87 
 
 		 516 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  38.43 
 
 		 505 aa  313  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 		 512 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  36.86 
 
 		 513 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  37.4 
 
 		 498 aa  312  6.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  36.74 
 
 		 512 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.14 
 
 		 524 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  34.79 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  36.1 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  36.56 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  36.27 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.16 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  35.45 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  36.07 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  36.44 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  36.06 
 
 		 514 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  37.57 
 
 		 524 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  37.94 
 
 		 516 aa  310  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  37.45 
 
 		 521 aa  310  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  36.6 
 
 		 501 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  35.73 
 
 		 504 aa  309  8e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  35.07 
 
 		 510 aa  309  8e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 523 aa  309  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>