More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0042 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  100 
 
 		 209 aa  413  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  61.58 
 
 		 210 aa  268  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  57.97 
 
 		 209 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 209 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  57.97 
 
 		 209 aa  254  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  59.9 
 
 		 215 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  59.9 
 
 		 215 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  59.9 
 
 		 215 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  59.9 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  59.9 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  59.22 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  59.22 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  59.22 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  59.22 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  59.22 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  59.22 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  59.22 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  59.22 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.74 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  58.22 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  58.22 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  59.7 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  58.08 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000509  nitrate/nitrite response regulator protein  55.88 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05381  transcriptional dual regulator NarL  56.22 
 
 		 204 aa  211  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  51.44 
 
 		 209 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  49.76 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  49.76 
 
 		 219 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  51.2 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  49.28 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  46.12 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  43.6 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  47.34 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  44.17 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  46.12 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  45.19 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  45.93 
 
 		 221 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  46.45 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  45.45 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  41.47 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  40.38 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2262  transcriptional regulator NarL  46.19 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0331529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.52 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2568  transcriptional regulator NarL  46.19 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.09 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  41.29 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  39.9 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1373  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.276843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.07 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1962  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1556  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  41.83 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1904  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1898  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.335981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2318  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.19 
 
 		 216 aa  154  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  40.28 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01199  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarX (or NarQ)  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2425  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00984481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1330  transcriptional regulator NarL  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.724195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1371  transcriptional regulator NarL  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.213666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1704  transcriptional regulator NarL  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1388  transcriptional regulator NarL  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2402  transcriptional regulator NarL  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1919  transcriptional regulator NarL  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.11445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01209  hypothetical protein  43.81 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.81 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>