270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0037 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 131 aa  257  5.0000000000000005e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  65.67 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  63.43 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  62.88 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  63.16 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  63.16 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  63.16 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  63.16 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  63.16 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  63.16 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  63.16 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  63.16 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  62.41 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  61.07 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  61.65 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  60.61 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  60.61 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  63.43 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  60.9 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  58.78 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  59.69 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  62.88 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  60.15 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  60.15 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  59.4 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  59.4 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  59.4 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  59.54 
 
 		 136 aa  153  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  58.02 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  58.02 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  58.02 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  58.02 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  58.02 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  56.49 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  60.61 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  60.61 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  57.25 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  57.25 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  60.61 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  60.61 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  60.61 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  60.74 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  55.97 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  56.49 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  57.58 
 
 		 139 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  56.49 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  56.39 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  51.15 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  57.14 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  56.49 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  55.73 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  51.18 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  55.73 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  53.24 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  54.61 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  55.38 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  47.37 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  48.55 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  49.64 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  53.33 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1655  large conductance mechanosensitive channel protein  54.17 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  54.31 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  47.01 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  47.01 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  52.54 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  52.54 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  55.81 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  44.68 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  45.52 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  48.89 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  48.55 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  55.47 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  55.47 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  55.47 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  46.02 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  55.47 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  44.78 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  46.56 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  46.56 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  54.69 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  46.96 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  52.31 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  48.15 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  44.78 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  53.49 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  53.49 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  44.12 
 
 		 143 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  53.49 
 
 		 132 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  47.55 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  45 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  52.43 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>