161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0034 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  100 
 
 		 530 aa  1100    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  53.11 
 
 		 535 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  53.6 
 
 		 532 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  50.58 
 
 		 540 aa  568  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  50.85 
 
 		 539 aa  555  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  49.52 
 
 		 532 aa  550  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  48.95 
 
 		 531 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  49.9 
 
 		 548 aa  539  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  47.79 
 
 		 538 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  48.28 
 
 		 539 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  45.71 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  47.62 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  27.72 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.14 
 
 		 496 aa  90.9  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.3 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.44 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.34 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  22.01 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  21.1 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  22.9 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  21.99 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  21.8 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  20.3 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  22.71 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  26.32 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  21.44 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  26.32 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  26.32 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  23.26 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  20.91 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  24.35 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  23.65 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  22.41 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  27.36 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  23 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.13 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  25.36 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  23.14 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  24.62 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  24.37 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  21.78 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  21.92 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  20.96 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  21.95 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  23.02 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  22.2 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  21.53 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  23.02 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  21.47 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  28.88 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  23.86 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  23.84 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  21.2 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  24.87 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  20.76 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  20.76 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  20.98 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  20.98 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  21.85 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  22.07 
 
 		 493 aa  57  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  21.18 
 
 		 493 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  21.55 
 
 		 496 aa  57  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  24.19 
 
 		 486 aa  57  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  22.79 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  21.41 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  22.54 
 
 		 496 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  24.88 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  21.41 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  21.41 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  24.88 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  24.88 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  24.88 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  20.65 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  21.23 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  21.41 
 
 		 493 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  20.93 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  22.33 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  23.11 
 
 		 484 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  23.81 
 
 		 505 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  22.54 
 
 		 492 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  25.36 
 
 		 492 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  20.17 
 
 		 515 aa  54.3  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  24.64 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.98 
 
 		 514 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  21.39 
 
 		 511 aa  53.5  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  22.84 
 
 		 485 aa  53.5  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  21.11 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  21.95 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  23.92 
 
 		 488 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  23.92 
 
 		 488 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  21.11 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  21.79 
 
 		 498 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  24.4 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  23.7 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  24.4 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  21.11 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  21.11 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  20.63 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  23.92 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  23.92 
 
 		 488 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>