More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0033 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  100 
 
 		 316 aa  607  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  61.24 
 
 		 318 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  61.24 
 
 		 318 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  61.51 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  54.33 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  54.33 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  54.33 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  51.31 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  42.77 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  42.47 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  41.46 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 348 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  38.82 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.76 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  36.08 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  35.8 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  35.11 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 353 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.38 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  30.33 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  30.33 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  30.33 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  30.33 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.86 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.21 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.14 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  30.5 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  30.8 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.57 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.57 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.69 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  33.33 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.53 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 835 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  29.17 
 
 		 312 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  33.57 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.61 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  30.16 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.68 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.62 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  30.71 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  32.91 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 		 359 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  33.97 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  30.72 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  31.7 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  31.94 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  29.3 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  31.89 
 
 		 327 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 353 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  30 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  31.89 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  29.61 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  29.61 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3252  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0683493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  29.41 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.49 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.49 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.49 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.49 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  30.98 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.49 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  29.22 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  29.41 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  31.82 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>