More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0032 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0032  sugar ABC transporter, permease  100 
 
 		 324 aa  633  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.81353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0388  sugar ABC transporter, permease protein  61.83 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0347  sugar ABC transporter, permease protein  61.83 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0394  sugar ABC transporter, permease protein  61.83 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  51.69 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0366  carbohydrate ABC transporter permease  52.36 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0433  monosaccharide-transporting ATPase  52.36 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1229  sugar ABC transporter permease  48.65 
 
 		 314 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.446632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4617  Monosaccharide-transporting ATPase  41.98 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5312  inner-membrane translocator  41.3 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0929  carbohydrate ABC transporter permease  41.72 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.306696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3400  monosaccharide-transporting ATPase  41.72 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3267  carbohydrate ABC transporter permease  41.4 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3637  monosaccharide-transporting ATPase  42.35 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0784  monosaccharide-transporting ATPase  40.79 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3561  monosaccharide-transporting ATPase  41.06 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  35.9 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4659  monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225069  normal  0.765727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4369  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.43 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3353  hypothetical protein  32.42 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2307  carbohydrate ABC transporter permease  35.22 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2408  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405486  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5190  Monosaccharide-transporting ATPase  35.35 
 
 		 352 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.71 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  33.9 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.9 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.9 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.79 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.14 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.14 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.14 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.14 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1268  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.24 
 
 		 356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14735 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3819  monosaccharide-transporting ATPase  33.9 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2300  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.047503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  34.53 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1338  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.87 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3318  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  29.83 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.43 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4061  monosaccharide-transporting ATPase  32.7 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.54 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1405  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.62 
 
 		 352 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.26 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  30.59 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.06 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.53 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  31.4 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  29.65 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.33 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  33.78 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  29.73 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  30.95 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.82 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  31.94 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  31.92 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  30.35 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  31.29 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  30.35 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  30.35 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  30.35 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  30.07 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  30.35 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>