More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0021 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  710    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  63.02 
 
 
341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  62.72 
 
 
341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  63.02 
 
 
341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  63.02 
 
 
341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  63.02 
 
 
341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
356 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.18 
 
 
339 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.08 
 
 
337 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
337 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 
337 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.05 
 
 
338 aa  200  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
338 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.08 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
340 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.94 
 
 
337 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.53 
 
 
349 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 
338 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  34.41 
 
 
338 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.73 
 
 
341 aa  186  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.86 
 
 
345 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
345 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
341 aa  185  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.43 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.03 
 
 
340 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
340 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 
343 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.44 
 
 
340 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  31.4 
 
 
340 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
335 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.36 
 
 
335 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.49 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.18 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
336 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
336 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
335 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
336 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  31.96 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.03 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.03 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.03 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  34.03 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.03 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.03 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.03 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.02 
 
 
342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.45 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.13 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.16 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  31.27 
 
 
343 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  33.23 
 
 
348 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  31.2 
 
 
343 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  30.88 
 
 
339 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  30.9 
 
 
340 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  30.88 
 
 
339 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  31.2 
 
 
339 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  30.88 
 
 
339 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.27 
 
 
350 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.27 
 
 
350 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.27 
 
 
350 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.58 
 
 
350 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.58 
 
 
350 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.27 
 
 
350 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  29.5 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  30.09 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  30.09 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  30.09 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.86 
 
 
339 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  30.09 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  30.09 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  28.16 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.15 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  31.76 
 
 
338 aa  166  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.96 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.96 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  28.05 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  29.79 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.59 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  36.19 
 
 
348 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  30.59 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.59 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  30.59 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
347 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.59 
 
 
339 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.62 
 
 
356 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.29 
 
 
339 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.32 
 
 
338 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.23 
 
 
325 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.82 
 
 
344 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  30.29 
 
 
339 aa  159  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.54 
 
 
351 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
337 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  32.8 
 
 
359 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.69 
 
 
336 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
346 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>