234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0015 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  100 
 
 		 258 aa  536  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1489  hydroxypyruvate isomerase  66.54 
 
 		 258 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0109  Hydroxypyruvate isomerase  64.98 
 
 		 260 aa  360  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0115  Hydroxypyruvate isomerase  64.2 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3135  hypothetical protein  61.24 
 
 		 258 aa  345  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02589  hypothetical protein  61.24 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02554  hypothetical protein  61.24 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2877  hypothetical protein  61.24 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0973  hypothetical protein  61.24 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898115  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0949  Hydroxypyruvate isomerase  60.85 
 
 		 258 aa  343  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3036  hypothetical protein  60.85 
 
 		 258 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3104  hypothetical protein  59.3 
 
 		 258 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3120  hypothetical protein  59.3 
 
 		 258 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0148759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3065  hypothetical protein  59.69 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765519  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3036  hypothetical protein  59.3 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0147  hydroxypyruvate isomerase, putative  55.04 
 
 		 261 aa  306  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.999741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0132  putative hydroxypyruvate isomerase  55.04 
 
 		 261 aa  306  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2552  hydroxypyruvate isomerase  51.75 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0908348  hitchhiker  0.00501624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04753  hydroxypyruvate isomerase  52.14 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0211  hydroxypyruvate isomerase  50.58 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  50 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3181  hydroxypyruvate isomerase  46.51 
 
 		 262 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  48.25 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  49.03 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4427  hydroxypyruvate isomerase  47.67 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  46.97 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0652  hypothetical protein  47.1 
 
 		 265 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07150  hypothetical protein  47.49 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3208  hydroxypyruvate isomerase  47.86 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5159  hydroxypyruvate isomerase  47.86 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1631  hydroxypyruvate isomerase  46.51 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0443  hydroxypyruvate isomerase  46.59 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0973  hydroxypyruvate isomerase  46.69 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5120  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3830  hydroxypyruvate isomerase  46.3 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2172  hydroxypyruvate isomerase  45.88 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1423  hydroxypyruvate isomerase  49.81 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1839  xylose isomerase-like TIM barrel  47.47 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0157456  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2311  hydroxypyruvate isomerase  47.06 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5077  hydroxypyruvate isomerase  47.47 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5927  Hydroxypyruvate isomerase  46.3 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1597  hydroxypyruvate isomerase  45.91 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45010  putative hydroxypyruvate isomerase  45.53 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1924  hydroxypyruvate isomerase  45.91 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0442  hydroxypyruvate isomerase  45.91 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2017  hydroxypyruvate isomerase  45.91 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4876  hydroxypyruvate isomerase  46.62 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1571  hydroxypyruvate isomerase  45.91 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2770  hydroxypyruvate isomerase  44.19 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0252433  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4298  hydroxypyruvate isomerase  45.91 
 
 		 260 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0573  hydroxypyruvate isomerase  45.53 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0894  hydroxypyruvate isomerase  45.53 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1861  hydroxypyruvate isomerase  45.53 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2169  hydroxypyruvate isomerase  45.14 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196604  normal  0.222817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3863  hydroxypyruvate isomerase  45.91 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531245  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5142  Hydroxypyruvate isomerase  46.24 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3623  hydroxypyruvate isomerase  45.53 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1298  hydroxypyruvate isomerase  43.92 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  43.53 
 
 		 263 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3413  Hydroxypyruvate isomerase  45.35 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3317  xylose isomerase-like TIM barrel  44.71 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.695295  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1395  hydroxypyruvate isomerase  43.53 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0279437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0020  hypothetical protein  45.95 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3955  hydroxypyruvate isomerase  45.85 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  43.92 
 
 		 260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  43.02 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2425  hydroxypyruvate isomerase  43.92 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6200  hydroxypyruvate isomerase  42.75 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0219655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1902  hydroxypyruvate isomerase  42.75 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1816  hydroxypyruvate isomerase  42.75 
 
 		 269 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1879  hydroxypyruvate isomerase  42.75 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0860973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2260  hydroxypyruvate isomerase  43.92 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2300  hydroxypyruvate isomerase  43.92 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1788  hydroxypyruvate isomerase  42.75 
 
 		 269 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3736  Hydroxypyruvate isomerase  44.19 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5179  hydroxypyruvate isomerase  42.75 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  45 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3378  hydroxypyruvate isomerase  42.02 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  0.0397331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2368  hydroxypyruvate isomerase  43.41 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  44.71 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3533  hydroxypyruvate isomerase  45.88 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  44.09 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  43.92 
 
 		 269 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4309  hydroxypyruvate isomerase  42.91 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0533507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3741  hydroxypyruvate isomerase  41.41 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3449  xylose isomerase-like TIM barrel  42.69 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1134  hydroxypyruvate isomerase  42.29 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.852559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  45.74 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2086  hydroxypyruvate isomerase  45.35 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43410  hydroxypyruvate isomerase  45.67 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5560  hydroxypyruvate isomerase  39.61 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.446227  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0462  hydroxypyruvate isomerase  45.74 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  40.71 
 
 		 260 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  43.24 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  41.9 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1621  hydroxypyruvate isomerase  44.31 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377689  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  40.93 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1133  hydroxypyruvate isomerase  41.47 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.926547  normal  0.304342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>